（十一）就先决问题设有停止诉讼程序
于司法二元化制度下，为避免不同法院系统的裁判结果发生歧异，就行政诉讼的裁判须以民事法律关系是否成立为准据，而该法律关系已经诉讼系属而尚未终结者，行政法院应以裁定停止诉讼程序。除前项情形外，有民事、刑事或其它行政争讼牵涉行政诉讼的裁判者，行政法院在该民事、刑事或其它行政争讼终结前，得以裁定停止诉讼程序。于民事或刑事诉讼的裁判，以行政处分是否无效或违法为据者，行政法院就行政处分是否无效或违法有专属审判权，而明定此一情形应依行政争讼程序确定之；如前项行政争讼程序已经开始者，于其程序确定前，民事或刑事法院应停止其审判程序。
（十二）增设权限争议的解决方法与释宪声请权
台湾地区采司法二元化制度，关于行政诉讼与民事、刑事诉讼的审判，分别由不同性质的行政法院与普通法院审理，故于发生审判权冲突时，宜设有解决之道。对此，“新法”明定行政法院就其受理诉讼的权限，如与普通法院确定裁判的见解有异时，应以裁定停止诉讼程序，并声请司法院大法官解释，以解决审判权的积极冲突。
（十三）修正裁判的强制执行
“新法”增订第八编“强制执行”，撤销判决确定者，行政机关应即为实现判决内容的必要处置。如行政诉讼的裁判系命债务人为一定给付者，此一裁判得为执行名义，声请高等行政法院强制执行。如债务人为中央或地方机关或其它公法人者，并应通知其上级机关督促其如期履行。至于强制执行机关则明定得由高等行政法院下设执行处为之，惟亦得嘱托普通法院民事执行处或行政机关代为执行，有关强制执行的程序，原则视执行机关为法院或行政机关而分别准用《强制执行法》或《行政执行法》的规定。
（十四）增设简易诉讼程序
为加速诉讼事件的进行，减轻法院工作的负担及当事人劳费，对于轻微事件，“新法”设有简易诉讼程序。
（十五）修正诉讼费用规定
关于行政诉讼应否征收费用，“新法”仍延续旧法无偿主义的精神，明定不征收裁判费，以宣示行政诉讼系以保障人民权益、确保国家行政权的合法行使为宗旨，惟仍应征收“其它进行诉讼的必要费用”，以维公平原则。
（十六）采逐条列举准用《民事诉讼法》
鉴于“新法”具有独自的行政诉讼制度，为达与民事诉讼制度和刑事诉讼制度三法鼎足并立，故有关各项诉讼程序及审理原则，均尽量予以明文详尽规定。其有须准用《民事诉讼法》者，亦采逐条列举准用方式。
三、新《行政诉讼法》的修正研究
整体而言，“新法”，无论于制度结构或体系内容，可谓是与德、法、日等传统法制先进国家并驾齐驱。然而，从1981年7月组成“修正委员会”到2000年7月1日公布实施，自今期间长达十余年，期间国内外法制及相关理论已多所变革，加以“新法”因立法技术等因素，若干规定本身即有欠妥适，一经实施，实务上即陆续产生若干问题亟须解决。对此，台湾地区“司法院”复于2001年3月开始再进行“新法”的检讨修正作业。先后共进行四次修正，以下将各次的修正时间和修正重点简介如下：
（一）“第一次修正”的重点
本次修正于2007 年 6 月 5 日通过，2007年 7 月 4 日公布，2007年 8 月 15 日实施。本次共新增10条，修正8条，重点如下：
1.审判权方面
向无审判权法院起诉，改采职权移送制。为保障当事人免于承受诉讼审判权归属认定及移转的不利益，增订行政法院对其认为无受理权限的诉讼，应依职权移送至有受理诉讼权限的法院，免除人民承受审判权错误的不利益，以保障其诉讼权。
