台湾地区检、警关系在实践中的“走样”，原因是多方面的：
其一，台湾地区检察官与司法警察的专业能力存在差异，检察官的养成教育和专业训练，偏重于法律面，而关于犯罪学、犯罪侦查学等，并未有足够的专业知识和训练；反观警察人员的教育、训练过程，其所侧重者并非法律层面，而是关于侦查、取证技巧。因此，在侦查实务上，关于调查、取证部分，实际上只能由警察机关主导，检察官往往不能给予司法警察实质上的指挥，而只能就法律面给予建议。同时，现今刑事侦查学的发展早已今非昔比，调查、取证更倚重科学技术手段，而检察官不仅缺乏有关的专业训练，更缺乏相关的科技装备与技术人才。{29}
其二，台湾检察官的人力严重不足{30}，要求检察官承担主要侦查任务并不现实。根据台湾地区“法务部”的统计，虽然近年来，台湾检察机关为适应“刑事诉讼法”的修改以及“改良式当事人进行主义”诉讼模式的确立，不断扩充检方人力，各地检署及“高等法院检察署”的检察官人数已从 2000 年的 694 人增加到 2004 年的 983 人，但同一时期，检方的收案数也在递增。折算下来，从 2000 年到2004 年，地方法院检察署每位检察官每月办案折计数在 130 件左右“，高等法院检察署”每位检察官每月办案折计数为 60 件左右。{31}即使每个月满打满算按 30 天计，地检署的每位检察官每天也要处理 4 件案件。如此大的案件量，即使为每位检察官配备 1 名检察事务官，要求检察官实际担负起所有案件的犯罪侦查职责，也恐有心无力！
其三，台湾地区检警机关在组织上互不隶属，检察官在组织隶属上归属“法务部”，而警察则归于“内政部”（调查员则另属于“法务部”下辖之“调查局”），由于组织上分立而互不隶属，检察官与司法警察之间在犯罪侦查的事权协调或指挥调度，往往产生困难和障碍，更由于不同机关之间各有其组织文化与传统，彼此之间容易产生沟通不良甚至相互抵触的问题。因此，即使台湾地区“刑事诉讼法”第228 条以下清楚规定检察官有权指挥、调度司法警察，台湾“调度司法警察条例”更明确赋予了检察官对司法警察有“嘉奖、记功、记大功”或“申诫、记过、记大过”甚至“函请该管长官予以撤职或其他处分”的权限，但这种指挥关系实际上却相当的不安定。{32}
正由于台湾检、警关系的“名实不符”，导致实践中检、警关系不畅，检、警之间多年来一直处于“紧张气氛”之下，不少基层警察并不认同检察官对司法警察的指挥、调度权：一则因为检察官对犯罪侦查的专业能力不足以令司法警察信服；二则个别检察官态度傲慢，在受理司法警察申请拘票、监听票时百般刁难及挑剔，让警察感到毫无尊严。因此，实务中不少司法警察在心态上常常不愿积极配合检察官的指挥，在受到检察官的指挥、调度时，往往以需要层报上级机关同意为由进行“技术性抵制”。{33}而检察官也经常指责警方素质不佳，实践中检察官宁愿指挥检察事务官办案，也不愿调度警察予以配合。{34}
同时，也正因为台湾地区检警关系的实务现状与“立法”并不相符，因此，理论上往往称检察官为侦查权的“形式主体”，而称警察为侦查权的“实质主体”。而台湾学术界也一直有观点主张，从侦查实际情况出发，应赋予司法警察独立的侦查权限和侦查主体资格，使其与检察官之间构成彼此相互协助的“双侦查主体”，即以侦查“伙伴关系”取代“将兵关系”。{35}
三、检、审关系：组织分隶与不告不理
在台湾地区，处理检、审关系的基本原则是组织上的“审、检分隶”以及程序上的“控审分离（不告不理）”。
在 1979 年实行审检分隶之前，台湾地区司法体制比较奇特，法院系统中仅有“最高法院”隶属于“司法院”，“最高法院”法官的任免由“司法院”负责“，最高法院检察署”的检察官，则由“司法行政部”任免；而高等法院以下各级法院，则隶属于“司法行政部”（嗣后改为“法务部”），高等法院以下各级法院所配置的检察官亦隶属于“司法行政部”，其任免皆由“司法行政部”负责。由于这一时期台湾地区“高等法院”以下检、审机关皆隶属于同一部门领导，且合署办公，因此，这一时期台湾的检、审关系在组织上体现为“审检合署”。
1979 年 4 月 6 日，为刻意营造“政治革新”形象，台湾地区决议实施“审检分隶”即“，高等法院以下各级法院，隶属于司法院。司法行政部，仍隶属行政院，掌理检察、监所及其他司法行政业务”，其主要内容及进行步骤如下“：一、高等以下各级法院，依照‘大法官会议’释字第八十六号解释，隶属于‘司法院’。‘司法行政部’仍隶属‘行政院’，掌理检察、监所及其他司法行政业务，以建立审检分隶新制。二、审检分隶之实施，审判方面：由‘司法院’设置机构，负责所掌业务之行政管理，加强对所属机关之行政监督。检察方面：各级检察机关仍配属于各级法院，并加强其权责与功能。”{36}
1980 年 7 月 1 日起，台湾地区正式实施“审、检分隶制”，高等法院以下各级法院，改隶于“司法院”，而原配属于各级法院的检察官则加以机关化，正式命名为“法院检察处”，隶属于“司法行政部”改制后的“法务部”。1980 年 6 月 29 日修正公布的“法院组织法”，将各级检察机关，而非检察官，配置于各级法院，以建立检察机关的完整体系。据此，台湾地区检察机关与法院在组织上实现了“审、检分隶”。之所以审检分隶后，仍称检察机关“配置于”法院，并非意指检察机关隶属于法院、检察机关为法院的附属机关，而是指检察官执行职务的管辖区域，以其所配置的法院的管辖区域为标准，但检察官对法院仍独立行使其职权。{37}
