黄浦江上游水源地处于开放式、流动性、多功能水域，上游来水水质不稳定且易受突发性污染事件影响；嘉定和崇明的原水保障问题急需解决；随着人口导入和产业结构调整，区域性供水矛盾突出，供水水质急需全面提高，城乡统筹供水任务还很艰巨，管网漏损率还偏高，二次供水设施改造仍须大力推进。
3.城乡河道水环境质量尚不稳定，治理任务仍很艰巨
本市城镇污水处理率虽已超过80%，但未纳管污染源仍面广量大，截污纳管和污水三级管网改造任务十分繁重；受雨污混接和初期雨水影响，部分河道“逢雨就黑”；污泥处理处置阶段性矛盾十分突出，目前，全市每日约有3000立方米污泥亟待处理；中心城区污水处理厂厂群矛盾加剧；郊区骨干河道、界河整治滞后，脏乱差现象还不同程度存在，城乡河道水质尚有反复。
4.农田水利部分设施老化失修，灌排标准有待提高
目前全市灌排泵站总数约6000座，其中部分设施年久失修，灌溉泵站装置效率较低；低洼圩区总体除涝能力不足，粮田、菜田高效节水灌溉设施和田间工程设施覆盖不全；此外，维修养护机制不健全，部分设施还存在失养、失管的现象，影响设施设备效益的充分发挥。
二、“十二五”发展思路
“十二五”期间，是上海加快推进“四个率先”、建设“四个中心”的关键时期，也是郊区城市化快速发展的重要时期，水务作为城乡发展重要基础设施保障，面临着新的发展形势。一是上海经济和人口规模持续增长，水资源约束和水环境压力有增无减；二是城乡统筹发展和民生改善对水务公共服务的需求持续增长并日趋多样化；三是发挥世博后续效应，需不断完善水务管理常态长效机制；四是农村水利基础设施薄弱，与加快推进新型城市化和新农村建设的要求不相适应。为此，上海水务“十二五”发展要更加注重安全保障、资源节约、生态保护和农村水利建设，更加注重常态长效管理，不断完善覆盖城乡的现代水务保障体系。
（一）指导思想与基本原则
1.指导思想
紧紧围绕创新驱动、转型发展、改善民生的大局，以科学发展为主题，以提升公共服务和社会管理能力为主线，以体制机制和科技创新为驱动，坚持科学治水、依法管水，把资源节约、环境友好、生态文明、人水和谐理念进一步贯穿于水务工作全过程，切实加强综合性规划、系统性建设、长效化管理，推进安全资源环境协调发展、区域与流域联动发展、城乡水务一体化发展，进一步提高水务基础性保障能力，服务上海经济社会平稳健康发展。
2.基本原则
（1）坚持服务民生改善
水务发展要与城乡经济和社会发展要求相适应，从保障人民生命财产安全、提高人民生活水平和生活质量的实际要求出发，着力解决好与民生改善密切相关的水问题，不断满足人民群众对水安全、水资源、水环境的新需求。
（2）坚持注重安全保障
水务安全关系到社会稳定和城乡经济社会发展大局，必须把特大型城市的水务安全保障放在首要位置，统筹协调“安全、资源、环境”的关系，采取切实有效措施，防范灾害风险，加强应急管理，保障城乡生活和生产平稳有序。
（3）坚持统筹城乡发展
加快城乡一体化发展，是增强本市综合实力的内在动力。必须坚持城乡统筹发展，更加注重郊区水务基础设施建设，分类指导、聚焦重点，逐步实现水务公共服务均衡化。
（4）坚持保护节约资源
实施最严格水资源管理，是加快转变经济发展方式的战略举措，要按照生产发展、生活富裕、生态良好的文明发展道路要求，把资源节约、环境友好、预防为主、强化保护放在更加突出的位置，统筹协调开发与保护的关系，实现水资源的可持续利用。
（5）坚持强化建管并举
水务管理是政府管理的重要组成部分，要按照建设“两高一少”政府的要求，充分发挥水务行业监管的作用，在强化管理中优化服务，在优化服务中强化管理，进一步完善法制、体制、机制建设，建立健全制度化、规范化、长效化的水务管理机制，不断提高水务服务管理的现代化水平。
