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2008年，上海率先提出“卓越工程教育”、“卓越科学教育”、“卓越医学教育”和“卓越文学艺术教育”计划，并确定了先行先试高校。率先构建集人才培养、科学研究、队伍建设、国际化和机制创新为一体的全市高校内涵建设项目库。全市高校形成了就业、创业教育服务体系。十一五期间，上海高校毕业生就业率持续领先全国。2009年，在受到世界金融危机冲击的不利条件下，上海高校毕业生就业率仍稳定在90%以上。
4．知识创新和服务能力得到有效提升
“十一五”期间，高校成为上海知识创新的主力军，科研水平明显提升：一是科研基础水平和研究成果进一步增强。吴孟超、谷超豪、王振义先后获国家最高科技奖。累计获专利申请28677项，比“十五”期间增长185.4%，获专利授权13595项，比“十五”期间增长357.4%。SCI论文收录41781篇，比“十五”期间增长148.7%，EI论文收录35866篇，比“十五”期间增长128.4%。ISTP收录18817篇，比“十五”期间增长195%。二是科技经费收入持续增加。“十一五”期间，上海高校获得科技总经费为345.7亿元，比“十五”期间增长117.1%。其中2010年科技总经费超过亿元的学校和附属医院有12所。三是科技成果转化和产学研合作取得突破。2010年上海高校科技合同登记3318项，技术合同成交金额达8.23亿元。
5．教师队伍建设得到高度重视
“十一五”期间，上海高校教师队伍初步形成开放和有序流动的良性格局，教师规模小幅增长。2010年，上海普通高校专任教师达3.92万人，比“十五”末增加23.3%。高层次人才队伍竞争力提升较快：到2010年底，高校在职在编人员中拥有两院院士80人，国家“百千万工程”人选166人，教育部“长江学者”150人，国家杰出青年212人，全国高校教学名师30人，上海领军人才172人。截至2010年，上海高校共引进国家“千人计划”专家99人。
2007年底起实施“上海高校特聘教授（东方学者）岗位计划”，2008-2010年引进高层次人才166人，投入资金达7500万元。加强对中青年教师培养资助力度，2005-2010年共投入13700余万元，资助了5159位高校青年教师，占青年教师总数的近四分之一。全面实施岗位设置管理为基础的教师及其他专业技术职务聘任制。
6．高等教育国际化水平取得长足进步
“十一五”期间，中外合作办学呈现多样化发展趋势，既有独立设置机构，又有普通高校二级学院，还有针对某些专业、学科和课程合作举办的项目。实施本科及以上学历教育的机构和项目数已从“十五”末的30%增至“十一五”末的42%；同期来华外国留学生中学历生数从6310人增至13150人，其中12所高校的外国留学生人数超过1000人。“十二五”期间本市高校共聘请外籍专家5704人次。
（二）主要问题
1．育人为本的根本要求尚未得到完全落实
“为了每一个学生的终身发展”的理念在高校办学中尚未得到充分体现，人才培养在高校工作中的中心地位尚未完全确立，人才培养质量尚未成为衡量高校办学水平的根本标准。高校片面追求综合化和上层次倾向仍较严重，尚未根据经济社会发展需求及高校的特点和类型确定人才培养目标、规格；人才培养模式创新不足，教学实践环节比较薄弱，学生综合素质和实践技能有待提升，产学研联合培养人才的机制尚待进一步健全与完善；全体教师、全社会全心支持大学生思想政治教育的意识有待进一步增强，全方位参与大学生思政工作的体制机制还需进一步完善。
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