市财政局负责专项资金的预算安排、项目资金分配和资金拨付，对专项资金的使用情况进行监督检查，会同市工信局、市科技局对申报项目（企业）进行遴选、审核、评审和绩效评估。
市工信局负责编制全市工业与战略性新兴产业发展规划，确定年度重点支持领域，组织项目（企业）申报，会同市财政局对申报项目进行审核，提出专项资金使用计划，监督项目启动和运行，组织项目绩效评估。
市科技局负责编制全市科技支撑战略性新兴产业发展规划，确定年度重点支持领域，组织项目（企业）申报，会同市财政局对申报项目进行审核，提出专项资金使用计划，监督项目启动和运行，组织项目绩效评估。
第二章 专项资金使用原则
第六条 专项资金使用应当遵循以下原则：
（一）政府导向原则。全面贯彻国家、省、市有关决策部署，围绕培育发展工业与战略性新兴产业的重点任务，与“十二五”规划相衔接，突出重点，以促进工业与战略性新兴产业结构优化、快速发展为主攻方向。
（二）规模效益原则。集中有限财力优先支持基础条件好、创新能力强、带动作用大的工业与战略性新兴产业重点项目、科技创新成长型企业、“专、精、特、新”中小微企业和重点研发机构，培育若干个引领经济持续快速发展的支柱产业和优势产业。
（三）科技引领原则。鼓励创新，突出科技支撑作用，加强产学研结合，促进科技成果转化和产业带动，加强重点产业关键共性技术攻关，支持突破工业与战略性新兴产业发展瓶颈的、能够抢占行业制高点的关键技术项目。
（四）引导激励原则。充分发挥专项资金杠杆作用和乘数效应，激励和调动工业与战略性新兴产业企业加大技术改造和科技创新的积极性，引导社会资金积极投入工业与战略性新兴产业，带动产业发展壮大。
第三章 专项资金支持领域及重点
第七条 工业及战略性新兴产业支持领域及重点：符合我市工业与战略性新兴产业发展规划，对先进装备制造、光电信息、生物医药、新能源、新材料等“五大”战略性新兴产业发展有重大影响的企业或项目；围绕工业与战略性新兴产业发展市政府确定的节能减排、重大工业项目规划、产业配套升级、工业运行和要素保障、工业经济发展宣传、专题会议和专项考察以及表彰奖励等其它事项。
