（六）负责渔业行政执法监督管理；负责渔船检验和渔船渔港安全监督管理；协助有关部门维护渔业水域生态环境，保护珍贵稀有水生野生动植物。
（七）负责动物防疫工作。指导动物防疫体系建设；负责动物、动物产品（不含出入境口岸动物检疫）的检疫工作和其他有关动物防疫的监督管理执法工作；组织重大动物疫情的监测、调查、控制、扑灭等应急工作。
（八）拟订畜牧渔业科技、教育培训、技术推广规划并组织实施；指导畜牧水产技术推广体系建设；组织畜牧渔业重大科研和技术推广。
（九）按照权限监督管理畜牧渔业专项资金，提出专项资金安排计划；组织畜牧渔业重大项目的申报、审核。
（十）承办市委、市政府和市农业局交办的其他事项。
三、内设机构
根据上述职责，市畜牧兽医水产局设9个内设机构：
（一）办公室
负责机关日常工作的协调和督办；负责文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作；负责来信来访、政务公开、安全保密、综合治理、维护稳定工作；拟订畜牧渔业发展战略、中长期发展规划，经批准后组织实施；负责人大代表建议、政协委员提案办理工作；负责机关离退休人员管理服务工作；负责机关后勤服务管理、接待工作。
（二）人事科（监察室与其合署办公）
负责局机关和直属单位机构编制、干部人事、劳动工资、社会保障、专业技术职务评聘和人事档案管理工作；负责机关和直属单位党务、纪检、监察、群团工作。
（三）财务科
按照畜牧水产业发展规划，组织编制项目资金年度计划；负责畜牧水产项目资金的申报和管理；负责监督检查畜牧水产项目资金使用情况；负责机关财务工作，指导局属单位财务管理。
（四）法制科
负责畜牧渔业方针政策和法律法规的宣传，提出组织实施意见；负责机关规范性文件合法性审核；组织开展畜牧渔业执法监督检查；负责行政复议、行政应诉、行政赔偿等工作。
（五）畜牧科
负责指导畜牧业、草业产业结构和布局调整；负责组织畜禽资源、牧草资源的保护和合理开发利用及畜牧业物种资源的保护和管理；指导畜牧业标准化生产和规模养殖；负责种畜禽管理工作，指导畜禽良种繁育体系建设；负责全市畜牧业商品基地和畜牧产品加工龙头企业建设管理；指导牧草基地建设、牧草资源开发利用以及草原（草地）鼠虫害测报与防治工作。
