㈡ 监督管理科。
负责旅行社（公司）的注册审核；负责自治州3A级以下景区评定及自治区三星级以下农（牧）家乐、工业旅游示范点的评定审核；指导旅游强县的创建复核工作；负责三星级以下旅游星级饭店的评定及复核工作；负责向自治区旅游局呈报各类旅行社（公司）资质等级评定和年审、年检结果的意见；负责旅游教育、培训工作；负责导游资格审批、审查及年审工作；贯彻实施旅游从业人员职业资格制度和等级制度；负责制定自治州旅游人才培训规划；负责全州旅游统计工作；负责对经营旅游业务的旅行社（公司）、旅游星级宾馆（饭店）进行行业管理；负责对全区旅游车辆、旅游商品、旅游纪念品等进行行业指导和监督管理；负责旅游纪念品的开发；负责监督全州旅游国债资金和项目资金的使用情况，并对全州旅游行业财务工作进行检查指导；承担边境旅游、特种旅游、红色旅游、特色旅游等相关管理工作；负责旅游信息化建设工作；负责自治州旅游统计工作；承担旅游安全综合协调及安全生产工作。
㈢ 旅游促进科。
负责研究国内外旅游市场发展态势，拟订自治州旅游业发展规划并组织实施；拟订自治州国内外旅游市场开发计划并组织实施；负责拟定自治州旅游市场的开发战略；负责组织自治州旅游整体形象的对外宣传，指导重要旅游产品、重大旅游节庆活动的宣传促销，引导旅游业的招商引资工作；负责贯彻落实国家、自治区旅游政策，进行旅游业务的宏观管理；负责国内外新闻媒体的接待工作；负责自治州旅游景区（点）规划、开发、建设和宏观管理；指导全州旅游基础设施建设工作。
纪检（监察）组：负责机关和直属事业单位党的纪律检查和行政监察工作。
四、人员编制和领导职数
自治州旅游局列全额事业编制11名，其中：县级领导职数3名（含纪检组长），内设机构科级领导职数4名。
五、事业单位
博尔塔拉蒙古自治州旅游执法支队。相当于科级，全额拨款事业单位，隶属于自治州旅游局管理。列全额事业编制3名，其中：科级领导职数1名。
主要职责：负责旅游行政执法和处罚工作；受自治州旅游局委托，受理和处理旅游投诉案件及相关工作；负责旅游市场秩序的规范工作；负责旅游质监执法工作的信息化建设；负责自治州旅行社（公司）旅游质量保证金管理工作。
