㈢ 地籍规划科。
负责城乡地籍和地政管理工作，拟订并组织实施自治州土地资源的现状调查、地籍调查、变更调查、动态监测和统计的有关规定；负责土地证书年检工作；组织土地确权、登记、发证工作；指导管理地籍信息系统的建立与维护；组织拟订自治州地籍工作计划和地籍管理技术规程；负责拟订土地权属管理办法；参与调处跨县市及有重大影响的土地权属纠纷；编制并组织实施土地利用年度计划；指导和审核县市、乡镇土地利用总体规划的修编；指导和审核基本农田保护规划、土地复垦规划、土地整理规划、未利用土地开发规划等专项规划；对建设用地进行预审；参与报自治州、自治区人民政府审批的城市总体规划的审核工作；负责自治州国土资源综合统计工作。
㈣ 矿产开发管理科。
负责起草编制并组织实施矿产资源保护与合理利用总体规划；依法进行采矿权审批登记发证和采矿权转让审批，指导采矿权依法流转；负责矿产资源开发、利用与保护的监督管理，负责对矿产企业“三率”指标的制定及考核；掌握辖区内矿业开发动态和统计年报的汇总上报；组织查处破坏矿产资源的违法活动；组织指导本州矿产资源补偿费的征收和逐级划缴；对各县市难以征收的矿产资源补偿费进行直接征收；负责矿产资源补偿费用于矿产资源保护的专项资金项目的立项审查，项目实施的监督检查及验收工作；审核确认采矿权评估结果。
纪检（监察）组：负责机关及直属事业单位党的纪律检查和行政监察工作，指导国土资源系统党纪、党风和行政监察工作。
四、人员编制和领导职数
自治州国土资源局（测绘局）机关行政编制11名。其中：县级领导职数4名（含纪检组长），内设机构科级领导职数5名。
按规定核定机关工勤事业编制3名。
五、事业单位
㈠ 博尔塔拉蒙古自治州处理土地纠纷领导小组办公室。相当于副县级，全额拨款事业单位，隶属于自治州国土资源局管理。列全额事业编制4名（含工勤事业编制1名），其中：领导职数2名（副县级1名，正科级1名）。
主要职责：按照国家、自治区和自治州有关土地、草场、森林、矿山、水资源等法律、法规，检查土地、草场、林地、矿山、水域等纠纷处理的执行情况；会同有关部门提出处理土地、草场等纠纷的配套办法和意见；负责并组织有关部门调查、裁定州内土地、草场、矿山、林地、水域等权属纠纷；督促、检查并指导县市政府以及有关业务部门对土地、草场等纠纷的处理情况；负责答复和处理人大、政协关于土地、草场等纠纷方面的意见、建议、提案等工作。
