指挥部办公室及各成员单位职责按工作需要分组如下：
指挥部办公室：按照本应急预案要求开展工作。具体负责传达、贯彻指挥部决策部署；按照指挥部指示召开有关会议、制发文件；收集、上报和通报相关信息；按照规定提出启动和终止预案的建议；负责与成员单位的协调工作，联系应急专家组。
牵头单位：市海洋局、市应急办；成员：市海洋局相关工作人员、指挥部各成员单位联络员、应急专家组组长。
抢险救灾组：指挥或者组织海上作业人员、船舶靠岸避灾，沿岸高危地带群众撤离，加强沿岸堤坝巡防；负责加固堤坝、疏散人员、清理现场，搜索营救被困群众和受伤人员，发动基层干部群众开展自救互救，组织救援人员和物质的运输工作等。
牵头单位：当地人民政府；成员单位：市海事局、水产畜牧兽医局、水利局、林业局、教育局、旅游局、安监局，公安局、武警支队、防城军分区、港务集团、中国移动通信防城港分公司。
救灾物资资金保障组：负责制定实施受灾群众救助工作方案以及相应的资金物质保障措施，保障灾区生活必需品供应，指导有关地区做好因灾倒房群众的紧急安置，保障灾区群众基本生活，保障灾区市场供应，接受和安排国内捐赠、国际援助，处理涉外事务，处理遇难者善后事宜等。
牵头单位：市民政局；成员单位：市财政局、商务局、发改委、工信委、住建委、交通局、市铁路办、港务集团，东兴市、防城区、港口区人民政府。
监测监视组：负责风暴潮、海浪、海啸监测和有关次生灾害防范，做好风暴潮、海浪、海啸的观测、监测和预报预警；调集必要的技术力量和设备，密切监视灾情发展，及时发布和报告灾害发展趋势。
牵头单位：市国土资源局（海洋局）；成员单位：市水利局、气象局、地震局、海事局、水产畜牧兽医局、安监局，东兴市、防城区、港口区人民政府。
卫生防疫组：负责医疗救助和卫生防疫，组织医疗救护队伍，调集医疗器械、药品，对受伤人员进行救治；伤员转运护送；检查、监测灾区饮用水源和食品，防范和控制各种传染病等疫病的暴发流行。
牵头单位：市卫生局；成员单位：市红十字会、市水产畜牧兽医局、环保局，港务集团、武警支队，东兴市、防城区、港口区人民政府。
基础设施保障组：负责铁路、公路、桥梁、隧道等交通设施，供电、供水、供气、通信等设施抢修维护；组织调集抢险救援装备，协调运力，保障灾区抢险应急物资供应。
牵头单位：东兴市、防城区、港口区人民政府、江山管委；成员单位：市发改委、工信委、住建委、国土资源局（含海洋局）、财政局、交通局、供电局、市政局、水利局、环保局、农业局、铁路办、教育局、旅游局、水产畜牧兽医局、农业局、林业局、商务局、铁路办、中国移动通信防城港分公司。
社会治安组：负责协助灾区加强治安管理和安全保卫工作，预防和打击各种违法犯罪活动，维护社会治安、维护道路，加强对党政机关、要害部门、金融单位、储备仓库等重要场所的警戒，切实维护社会稳定。
牵头单位：市公安局；成员单位：武警支队，东兴市、防城区、港口区人民政府。
应急专家组：负责对风暴潮、海浪、海啸灾害警报发布、应急预案启动等方面提供建议和业务咨询。
牵头单位：市海洋局；成员单位：东兴市、防城区、港口区海洋部门，市有关部门和区内有关大专院校、科研单位专家。
3. 风暴潮、海浪、海啸灾害预防预警
3.1 风暴潮、海浪、海啸灾害预防预警技术支持
