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2.南屏瑶族乡中部土壤保持功能区
该区总面积61.9km2，占全市土地面积的1.0％，范围包括南屏瑶族乡中部。该区海拔150～300m，大部分地区为土壤侵蚀高度敏感区，坡度大，土层薄，土壤主要为赤红壤，石砾含量高。
本区主导生态服务功能为土壤保持。
主要生态环境问题：不合理的土地利用、过度毁林开垦，森林覆盖率低；肉桂、八角人工纯林面积比重较大，林种和群落结构单一，森林涵养水源、保持水土等生态服务功能下降；耕地面积过大，水土流失严重，土地生产力下降，容易发生地质灾害。
主要保护方向与措施：重点保护和恢复天然植被，提高水土保持功能。加强生态公益林的建设，以及对天然林、水源林和防护林的保护管理，实施退耕还林工程措施，恢复水源涵养和保持水土等生态服务功能；对土地利用进行长期科学的规划和土地整理，治理水土流失，加强地质灾害的监控。
（四）海洋生物多样性保护功能区
1.北仑河口至珍珠港海洋生物多样性保护功能区
该区面积30.0km2。分布于北仑河口至珍珠港近岸，区内的红树植物群落分为海岸红树植物群落和海岛红树植物群落两大生态类群，一些半红树植物，如黄槿（Hibiscus tiliaceus）和海杧果（Cerbera manghas），也形成了比较明显的群落，这些群落一般与潮滩上的真红树群落相邻，并多呈窄带状或小斑块状分布。红树林是许多陆地鸟类、兽类觅食及栖息的场所，有利于浮游生物的繁衍，有利于鱼、虾等栖息繁殖。故该区内鸟类、鱼类和其它海洋经济动物的种类和数量都较丰富。
本区的主导生态服务功能为红树林生态系统和海洋生物多样性保护。
主要生态环境问题：当地居民生产活动的不良影响，保护区周边少数村民滥采滥捕滩涂海洋经济生物，养殖场污水的威胁；人类活动频繁，对栖息地干扰和破坏大；保护区资金投入不足，基础设施建设和保护区功能区规划尚未完善。
主要保护方向与措施：重点建设和保护北仑河口自然保护区，加强对红树林生态系统的完整性和生物多样性的保护和恢复。进一步完善保护区规划和管理制度，加大保护区各项基础设施和管理系统的建设；恢复已被破坏的沿海湿地，保护和恢复沿海红树林和海草生态系统的完整性和稳定性，为海洋生物和鸟类提供优良的栖息和繁衍场所，保护和提高其生物多样性；禁止在自然保护区内的进行各种开发活动和人类干扰；加强保护区和周边的养殖业和建设项目管理，禁止污水直接排入保护区内。
2.防城港东湾海洋生物多样性保护功能区
该区面积3.0km2。分布于防城港东湾近海海域，是我国大陆沿海城市区域红树林种类分布面积最大区域。1999年，自治区发改委立项批复设立该区为防城港东湾红树林海洋生态实验园区。 2003年，国家环保部（原环保总局）将该园区项目列入《国家环境保护“十五”重点项目规划》。2005年，该园区成为联合国环境署（UNEP）／全球环境基金（GEF）联合设立的《扭转南中国海和泰国湾环境退化趋势项目》国际示范区。
本区的主导生态服务功能为红树林生态系统和海洋生物多样性保护。
主要生态环境问题：海洋资源无序开发，近岸的工业和水产养殖污染严重；人为的过度干扰活动导致红树林生境破碎化，生态系统退化，多样性和稳定性受威胁较大。
主要保护方向与措施：加强对红树林生态系统的完整性和生物多样性的保护和恢复。做好区域开发的规划工作，加快污水处理设施的建设，控制工业和城市污染物的直接排放；加强海洋资源开发、水产养殖的集中管理和生态化养殖的的研究和应用；优化示范区周边的建设项目和生态旅游项目；为红树林示范区的管理建立了有效的民间合作模式，引入民间资金，加快红树林示范区的发展，促进红树林生态系统的恢复。
（五）海岸防护林功能区
该区面积26.3 km2，占防城港市土地面积的0.4％。该区包括茅尾海岸防护林带、企沙半岛山新海岸防护林带、企沙湾西部海岸防护林带、江山半岛大平坡海岸防护林带、氵万 尾海岸防护林带、巫头海岸防护林带、竹山海岸防护林带，主要是天然生态林及公益海防林、海岸带地区已经营造的林带，以及为减少风暴潮危害、改善环境而必须营造的林带。
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