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2012年，全市苗木花卉种植面积发展到79.6万亩，其中牡丹66.2万亩（观赏牡丹6.2万亩，油用牡丹60万亩），芍药1.9万亩，玫瑰0.2万亩，菊花等0.2万亩，园林绿化苗木4.1万亩，用材林5.8万亩，经济林1.2万亩；苗木花卉产业总产值达到75亿元。
2013年，全市苗木花卉种植面积发展到141.8万亩，其中牡丹127.4万亩（观赏牡丹7.4万亩，油用牡丹120万亩），芍药2.1万亩，玫瑰0.3万亩，菊花等0.3万亩，园林绿化苗木4.4万亩，用材林6.0万亩，经济林1.3万亩；苗木花卉产业总产值达到123.83亿元。
2014年，全市苗木花卉种植面积发展到204万亩，其中牡丹188.6万亩（观赏牡丹8.6万亩，油用牡丹180万亩），芍药2.3万亩，玫瑰0.4万亩，菊花等0.4万亩，园林绿化苗木4.7万亩，用材林6.2万亩，经济林1.4万亩；苗木花卉产业总产值达到172.65亿元。
到2015年，全市苗木花卉种植面积达226.5万亩，其中牡丹210万亩（观赏牡丹10万亩，油用牡丹200万亩），芍药2.5万亩，玫瑰0.5万亩，菊花等其它花卉0.5万亩，园林绿化苗木5万亩，用材林6.5万亩，经济林1.5万亩；苗木花卉产业总产值达到192亿元。苗木花卉自主创新品种达到20个以上，用材林、经济林良种率达95%以上，牡丹、芍药产品质量85%以上达到国际标准，轻基质盆花栽培率超过90%。
（三）发展重点。
1.新优品种选育。结合我市种质资源及种质资源项目，运用传统育种方法和现代育种技术，找寻目标性状突出、综合性状优良的育种材料，培育有重大应用价值的突破性新品种。建设省级特色苗木花卉区域工程中心3处，培育引进高产、优质、观赏价值高的观赏树木及花卉新品种，引进、选育优良品种40个。突出抓好国家牡丹种质资源库菏泽库、牡丹新品种测试基地和2个原种圃、3处良种繁育中心、2处大苗培育技术示范基地的建设，建设以生产良种为重点的采穗圃、种子园1处和牡丹芍药种苗繁育车间1处，进一步提高种苗产量和质量，加快推动良种化进程。
2.技术推广与基地建设。积极组织示范指导，大力推行基层农技人员包村联户，逐步实行农技人员抓科技示范户，科技示范户带动普通农户的技术推广模式。建立面积200亩的牡丹芍药种苗定向分类繁育基地一处；建立面积50亩的菊花、杨树、柳树、刺槐等种质资源库一处，保存种质资源350份；建立省级重点苗木花卉良种繁育场2处、科技创新园2处、树立省级品牌4个。发挥生产基地和示范园的带动作用，加大珍稀、乡土树种苗木培育力度，丰富城镇绿化树种多样性；采用先进技术，提高花卉种苗的繁育能力和水平，推广轻型基质容器化育苗；扩大传统优势花卉牡丹、芍药等优良品种的生产规模，促进产品数量质量同步提高。
3.花卉深加工及配套产业。以牡丹、芍药、玫瑰等传统优势花卉为重点，以药用、食用和工业应用为方向，特别注意牡丹药用价值、药用机理及黄酮、牡丹酚、芍药甙提取，大力发展牡丹“不凋花”、牡丹籽油萃取、牡丹系列化妆品、牡丹食品加工等相关产业。加强温室设备、容器育苗设备、园林器械的生产应用，提高苗木花卉生产设施化、机械化水平。
4.发展设施栽培。强化设施栽培，保证苗木花卉产品质量和周年化供应。提高设施栽培在苗木花卉中的比例，改造提升原有设施结构，以冬季牡丹催花日光温室为重点，推广应用设施内微滴灌、无土栽培、缓释肥栽培、二氧化碳补给、环境调控等技术，提升苗木花卉设施化栽培水平，提高苗木花卉产品质量。到2015年，实现冬季牡丹催花的轻基质无土栽培，扶持建设面积在2万平方米以上的日光温室花卉生产基地2处。
5.市场建设与社会化服务。整合苗木花卉营销资源，积极搭建现代化交易平台，推进苗木花卉市场建设。巩固和强化在全国花卉市场中的影响力，增加牡丹、芍药等地方花卉的出口，加大迎时花卉进口。完善花卉协会、苗木协会和各种中介组织，加快苗木花卉专业化合作组织建设。充分发挥协会作用，组织和协调苗木营销大户建立激励和约束机制，规范营销市场，防止出现倾销及其他不正当竞争行为。
（四）政策措施。
1.加强组织领导。各县区政府要把苗木花卉产业发展纳入当地国民经济和社会发展规划，制定加快苗木花卉产业发展的政策措施。建立健全苗木花卉管理机构，理顺隶属关系，提高苗木花卉产业管理能力。通过规划引导、政策扶持、示范带动等手段，整合产业要素，培植壮大产业发展核心竞争力。
2.强化行业监管。加强苗木花卉行业管理机构能力建设，提升监管和服务水平，加大行政执法力度，规范生产经营秩序，为苗木花卉的生产、流通创造良好的发展环境。建立健全苗木花卉质量检验监测体系，对苗木花卉生产、加工、包装、储藏和运输实施全过程质量管理，确保产品质量。
3.加大科技支撑。构建育种与繁殖、高新技术与常规技术、自主创新与引进吸收相结合的苗木花卉科技创新体系。加大科学研究、技术开发、成果转化和技术推广力度，重点开展具有自主知识产权的新品种选育、栽培技术研究和科技成果转化等。加强苗木花卉标准化建设，促进标准化生产。加大对苗木花卉人才的引进和培养力度，强化对苗农、花农的培训，提升产业从业人员整体素质。
4.落实优惠政策。进一步完善支持苗木花卉产业的政策措施，加大扶持力度，重点支持良种培育、技术推广、基地建设、设施栽培等。加强银企合作，鼓励金融机构加大对苗木花卉产业的金融支持力度。引导鼓励各类社会资金参与苗木花卉生产建设。严格执行国家规定的有关苗木花卉方面的税收优惠政策，维护生产者、经营者和使用者的合法权益，促进产业持续快速健康发展。
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