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（二）计划发展科技科
组织拟定全州科技发展中长期规划、年度计划。负责编制、平衡重点软科学研究计划，应用基础研究计划，科技攻关计划和促进科技成果产业化的实施。负责科技三项费、科学事业费和其他科技专项费的监督管理。研究拟定科学事业费、科研条件保障和科技财务管理等方面的措施和办法。会同有关部门拟定工业、农业发展战略、方针和政策，编制工农业、科技中长期发展规划和年度计划；组织协调跨地区、跨行业的重大科技攻关计划和科技创新工程，应用基础研究，推动农牧业、企业的技术进步。
（三）农村社会发展科技科
拟定科技促进社会发展的政策措施，组织实施社会发展科技项目，负责可持续发展和中药现代科技产业工作；推进社会发展领域科技产业和新兴产业的发展。指导、协调涉及人口、资源、环境、医药卫生、生态保护、减灾防灾等社会发展领域的综合科技工作。负责综合防治大骨节病试点工作科技攻关专家组的联系和协调工作。负责全州中藏药产业发展规划的制定、组织实施和指导检查工作。拟定农村科技发展和农业产业化的政策措施；负责农业科技项目管理，指导、协调农村科技产业和农业科技示范基地及先进适用技术试点、推广工作；会同有关部门建立农业科技推广体系和农村社会化服务体系。指导协调科普活动和科普教育基地的申报管理工作。会同有关部门开展党政一把手抓第一生产力目标责任制考核工作。
（四）知识产权管理科
负责有关知识产权法律法规的宣传贯彻和行政执法工作；配合有关部门拟定全州知识产权保护的政策、措施；协同相关部门负责全州知识产权行政执法工作。负责全州知识产权保护的综合管理工作和全州专利技术管理工作；负责专利申报、登记和推荐工作。拟定技术市场发展的政策、措施规划，负责技术市场管理的协调和业务指导、组织和统计分析工作，负责协调组织技术贸易活动，指导科技中介机构及民间团体的科技系统活动。负责全州科技奖励项目的申报、评审及科技成果档案的立卷、归档工作。
（五）高新技术与产业化科
拟定高新技术产业及园区发展规划和政策措施并组织实施；组织拟定工业科技发展战略、方针、政策、编制工业科技中长期规划和年度计划；负责经济发展工业科技及科技成果管理工作；组织工业科技成果推广、示范项目。
（六）州科技顾问团办公室
负责办公室和顾问团的日常工作；承办阿坝州经济发展专家指导委员会日常工作；编制州科技顾问团和顾问团办公室工作规划、计划、活动和工作总结；根据州科技顾问团领导的安排，对各种重大问题的调研、重要方针政策的咨询、重大项目的可行性论证、重大决策实施情况的追踪调查等活动进行具体组织、协调、服务；根据工作要求，联络、协调各顾问之间的关系；负责办公室文件的起草、审核和立卷归档工作；完成州委、州政府交办的其他工作。
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