（十二）制订医疗卫生科技发展规划。组织开展医疗科技活动，审查科研鉴定、成果评审，组织新技术开发、推广、运用，开展学术交流。参与制订医学教育发展规划，组织开展继续医学教育和毕业后医学教育工作。
（十三）负责实施医疗急救体系建设，指挥、调度急救资源，组织开展自然灾害、重大事故、突发公共卫生事件医疗急救。
（十四）负责集中采供血体系建设，依法监督管理血站、单采血浆站及临床用血质量，开展无偿献血宣传，组织公民无偿献血。
（十五）负责全州中医、民族医药机构行业监督管理，资格审查和综合能力建设指导、评审。负责民族医药惠民工程的实施、考核、检查。指导中医药、民族医药机构规范化建设、特色专病专科和名医工作室建设。负责民族医药发掘、整理、总结、提高，抢救和保护濒临灭失的民族医技、医药及单验方。组织开展新药开发和理论研究。指导民族医药制剂中心建设。承担中医、民族医药宣传、普及任务。
（十六）制定卫生队伍建设规划，提出政策建议。制订各级医疗卫生专业人员培训计划。负责实施提高农村卫生服务能力提高培训项目。组织实施继续医学教育、全科医生、学科带头人、专科进修、乡村医生、师承教育等培训。负责医疗卫生人员专业技术资格考试、考核和评审。组织开展医疗卫生职业道德教育和行业作风建设。
（十七）负责干部医疗保健工作。承担党和国家领导人、重要外宾来我州医疗卫生保障工作。承担重要会议与重大活动的医疗卫生保障工作。
（十八）承担州爱国卫生运动委员会、州食品安全协调委员会、州防治艾滋病工作委员会，州地方病及病害防治领导小组和州妇儿工委、州扶贫开发和综合防治大骨节病领导小组所涉卫生工作等具体职责。
（十九）承担州政府公布的有关行政审批事项。
（二十）承办州政府交办的其他事项。
三、内设机构
根据上述职责，阿坝州卫生局设11个内设机构：
（一）办公室
承办、督办、催办局务会、局长办公会议决定事宜。协助领导协调有关部门及科室。督办上级有关指示和各科室工作。制定机关工作规则和制度，并监督执行。负责综合性会议组织和公文处理，文秘事务，机要保密，档案、史志、年鉴。组织编制卫生目标，实施目标管理、考核和总结。负责信息化建设。抓好机关效能建设和文明单位建设。组织协调代表建议、委员提案办理。负责信息发布、公务车管理、后勤保障和安全防范、社会治安综合治理。承担卫生信息中心职能。
