二、内设结构
根据上述职责，阿坝州畜牧兽医局设7个内设机构：
（一）办公室
协调机关政务工作；承办重大会议的组织和重要文件的起草工作；负责信息、宣传、保密、文秘、档案、目标管理、政务公开、对外联络、办公自动化、应急管理、信访等工作；负责全局网络建设、后勤管理等行政管理工作。
（二）生产信息科
负责指导全州畜牧业生产和畜产品加工企业健康发展；管理和组织实施畜牧业生产性建设项目；研究拟定促进畜牧业发展的措施政策；指导畜牧兽医服务体系建设；指导畜牧兽医行业学会和畜牧专业合作组织建设工作；预测并发布畜禽及畜禽产品和畜牧生产资料供求信息，开展市场信息咨询服务，促进产品销售；指导畜牧业信息系统建设。
（三）计划财务科
负责拟定全州畜牧业发展中长期规划和年度计划并组织实施；负责机关财务、基本建设工作；负责国家、省和州畜牧业建设项目投资计划和资金的拨付，以及监督管理等工作，统一归口管理国家、省、州财政安排的各类畜牧业专项资金，负责州级畜牧事业经费预决算的编制、执行并实施综合平衡、监督管理；负责留州专项资金的财务管理；负责项目的编制申报等工作；监督管理直属单位国有资产；负责局机关和直属单位的财务监督管理工作；负责畜牧生产统计和定点调查工作；承担畜牧业对外经济合作和外资项目管理工作。
（四）草原科
负责草原管理、保护、开发、利用工作；研究指导牧草产业发展工作；指导优良牧草种子、牧草栽培和草地生态治理；负责草原建设项目的组织实施；负责草原防火工作；负责畜牧业机械化工作。
（五）兽医兽药科
负责全州兽医医政、兽药药政和饲料饲政监督管理；负责兽药、饲料生产、经营的监督管理；负责组织协调动物卫生监督管理和防疫检疫工作。
（六）质量安全监督管理科（行政审批科）
负责政策法规工作，负责草拟全州畜牧兽医行业政策法规，普法教育等；负责草原征占用的审批；负责父母代种畜禽场的生产经营许可；负责畜产品质量安全监督管理和重大畜产品质量安全事故处置等工作；组织实施畜产品质量安全监测，开展风险评估，会同有关部门发布畜产品质量安全状况信息；组织、协调对畜牧业投入品的监督管理；承担无公害、绿色、有机畜产品认证管理工作；负责行政效能建设工作。
