面上项目指南方向：
1、具有重要生物学功能的基因分离、克隆、功能鉴定和表达调控研究
2、重要蛋白质的结构与功能、调节及其应用的基础研究
3、细胞信号转导中分子间相互作用机理研究
4、胚胎干细胞的增殖与分化、诱导性多能干细胞重新编程的机理研究
5、细胞衰老、死亡、自噬、癌变或其他病变的分子机理研究
6、微生物代谢工程技术研究
7、新型生物活性物质产生菌的应用基础研究
8、新型高效表达系统的研究与应用
9、非编码RNA基因的鉴定及功能研究
10、非淀粉类生物质能源高效生物转化的关键技术研究
11、动植物全基因组关联分析鉴定重要生产性状基因研究
12、深度测序数据分析技术与应用
农业科学
本年度农业科学项目将在现代都市农业、生态安全、食品安全和低碳农业等重大和新兴方向予以重点支持，力争在农业（作物、园艺、畜牧）新品种、新技术、新工艺、新产品和相关应用基础理论方面有所突破，为农业结构调整与可持续发展，提供科学依据和技术支撑。
重大项目、重点项目指南方向：
1、农产品加工过程中生物活性物质的发掘及其稳定性研究
本方向重点支持研究农产品加工过程中生物活性物质的检测鉴定、组分分析及其化学结构和生物功能变化，分析生物活性物质在提取和加工过程中稳定性的变化规律、关键影响因素及其作用机理，探索保持生物活性物质稳定性、提高产率的加工新技术及新工艺。
2、设施作物品质形成的机理与调控技术研究
本方向重点支持设施作物品质形成的机理与调控技术研究，探讨设施作物外在和内在品质形成的关键生理生化基础，设施环境条件（光照、温度、湿度）对作物品质的影响及设施作物优质高效的水分养分调控及综合栽培管理技术等。
3、重要园艺作物野生优异基因资源的挖掘及细胞工程种质创新研究
本方向重点支持关于现代细胞工程技术在重要园艺作物野生优异基因资源的发掘及利用上的相关研究。包括克服有性杂交障碍，获得种间杂种的有效技术；减少非目标性状连锁累赘，促进异缘染色体重组，基因渐渗的技术；目标性状（或基因）的染色体及分子跟踪选择；远缘杂种的基因组及表观遗传变异等。探索结合现代细胞及分子遗传学研究手段，进行野生种优异性状定向转移的新思路和新技术，获得一批抗生物及非生物逆境新种质。
面上项目指南方向：
1、动植物重要性状种质资源的发掘、鉴定、评价及其在育种中的应用基础研究
2、作物优质、高产、抗逆和高效的遗传、生理生化基础及调控技术研究
3、养分、水分资源高效利用的土壤学及植物营养学基础和应用研究
4、逆境胁迫下作物、林木的生理生化变化规律及调控技术的研究
5、作物、林木主要病虫害发生规律及其综合防治原理与技术的研究
6、农畜产品贮藏保鲜、加工与冷链物流新技术、新工艺的研究
7、动物病原（包括人畜共患病）传播与流行成因、致病与免疫机制及其诊断与防治新技术的研究
8、饲料营养调控畜禽健康及产品品质的机理研究
9、低碳农业技术与途径
医药科学
医学是研究人类健康相关问题的科学，主要包括基础医学、临床医学、预防医学、药学和中医中药学等分支学科。结合医学科学发展和北京需求，本学科主要资助从分子、细胞、器官和整体等不同层面研究疾病发生、发展和转归的机制及相关疾病的防治研究。医药科学研究将对于提高北京市医学创新能力，满足人民群众日益增长的健康需求，提高公众健康保障水平，支撑医疗卫生体制改革的实施，培育发展生物医药战略性新兴产业，切实改善民生服务，以及完善北京创新体系，建设北京国际化城市具有重要意义。
本学科指南方向的制定是以转化医学思想为核心，以北京市重点攻关的十大类重大疾病为切入点，指南中所涉及的重大疾病是指心血管疾病、脑血管疾病、糖尿病、肿瘤（重点资助宫颈癌、乳腺癌的研究）、神经变性病、精神疾病（重点资助抑郁症的研究）、慢性肾脏病、脊椎和骨关节病；传染性肝炎、艾滋病、结核病，禽流感等新发突发传染病。
重大、重点项目鼓励多学科交叉融合、基础与临床相结合的研究。
重大项目、重点项目指南方向：
1、重大疾病早期预警、分子标记物的研究
本方向重点支持以重大疾病为研究对象，利用细胞、动物模型以及临床资源，研究近年新发现的分子标记物在重大疾病发生发展中的生物学作用、细胞信号网络中的调控机制及其与重大疾病发生、发展和转归的关系，探索重大疾病的早期预警综合方法。
2、免疫炎症在器官损伤中的作用及机制研究
本方向重点支持在整体、细胞、分子三个层次，体内体外途径研究器官早期损伤中各种因子的相互作用及信号转导通路，研究其免疫应答、免疫调节异常的特点和规律，探讨器官早期损伤的干预、控制方法，以期达到控制疾病的目的。
3、院内感染相关病原学快速检测、监测、预警及临床干预相关研究
以北京市大型综合医院出现的院内感染重要病原为研究对象，利用先进的分子诊断技术、信息平台以及临床资源，开展多学科交叉合作，建立及时、快速的、用于诊断多种院内感染病原（包括泛耐药的细菌、条件致病性真菌、传染性高的病毒）的技术平台；完善实时监控和预警体系；探索早期的干预措施，并验证其有效性；评估检测、监控、干预等综合技术平台对临床结局的影响。
4、北京地区人群健康管理体系建立的基础研究
本方向主要通过系统收集各类人群健康与慢性病疾病相关指标、行为危险因素、环境危险因素以及与遗传易感性密切相关的指标，建立并完善各类人群的健康风险预测模型。开展人群健康管理模式的研究，探索适应北京地区人群健康管理的的措施与方法。
5、突发公共事件中紧急医学救援中的关键技术研究
本方向拟通过系统回顾与总结近年来北京地区突发公共事件中紧急医学救援中的成功经验与待改进之处，科学总结与评价国内外各类典型紧急医学救援工作的经验，探索建立适应国情适应北京地区的突发公共事件中紧急医学救援模式与运行机制，探索制定常见自然灾害与事故灾难所致人身伤害的现场救助与医院急救的规范与标准。
6、重大疾病治疗药物先导化合物发现
重大疾病系指那些发病率高，对人类健康威胁大，治疗效果不理想和对社会有较大影响的疾病，如抑郁症，物质依赖等精神神经系统疾病，心脑血管疾病，代谢性疾病，肿瘤，感染性疾病和自身免疫性疾病等等。根据医学生物学的最新研究进展，确定侯选靶标，建立筛选模型；用药物化学或天然药物化学的方法获得化合物；通过多轮筛选实验和结构优化获得候选化合物；以公认的阳性药物为对照，对候选化合物进行主要药效学研究；开展作用机制，受体选择性和ADMET预测研究。在这些研究的基础上获得先导化合物（候选药物）。
