市三防指挥部成员单位和有关部门按照下述职责分工，各司其责，共同做好城区防洪工作。
市政府办公室：负责城区防汛抢险救灾重大事项、涉外信息发布及涉外新闻采访等协调工作；督促市三防指挥部各成员单位做好防灾抗灾救灾工作；组织市直有关单位做好南堤的防汛抢险工作；向省委、省政府汇报我市灾情以及抗灾救灾行动情况。
梅州军分区： 负责组织、协调驻梅96169部队、武警、边检等部队参加城区抢险救灾工作；组织所属部队和民兵预备役人员积极参加城区抢险救灾行动；协助城区各镇、街道办事处转移危险地区的群众、维护灾区社会秩序等工作。
中国人民解放军96169部队：负责组织驻梅96169部队实施抗洪抢险救灾，参加重要工程和重大险情的抢险工作，协助城区各镇、街道办事处转移危险地区的群众、维护灾区社会秩序等工作。
市宣传部门：负责把握防洪抢险救灾宣传工作导向，协调、指导新闻宣传单位做好防洪抢险救灾新闻宣传报导工作。
市水务局：负责组织、指导城区堤防、电排站工程的建设、管理；负责城区江南、江北的排涝工作，组织、指导城区江南、江北排水管（渠）道的维护管理；及时组织修复受损供水设施，确保城区供水安全；为城区防洪工程抢险提供技术指导；督促做好水毁堤防电排等水利工程的修复。
市发展和改革局：负责梅州城区防洪项目的立项、计划、建设和争取项目资金等协调工作；组织协调粮食部门做好救灾粮食储备、调拨和供应工作。
市经济和信息化局：负责协调邮政、电信、电力、商业、物资、药品等部门的防洪抢险救灾工作；负责协调商业企业做好灾区居民日用生活消费品的供应工作；协助统筹规划和协调市内各三防部门信息网络建设，合理配置资源，组织协调三防有关部门保障信息安全；负责三防系统无线电通信频率的指配和抗干扰、协调工作，保障三防无线电的通畅。
市教育局：组织做好城区可能受暴雨、洪水严重影响区域的学校和在校师生的防暴雨、防洪安全工作；根据《
广东省突发气象灾害预警信号发布规定》，适时通知城区学校停课；负责组织灾后校舍修复、重建工作；负责对在校学生进行防灾减灾应急知识的宣传教育工作。
市公安局：负责维护城区社会治安和交通秩序，依法打击造谣惑众和盗窃、哄抢防汛物资以及破坏防洪、排涝设施的违法犯罪活动；协助有关部门妥善处理因防洪抢险引发的群体性治安事件；协助组织危险地区群众安全撤离或转移。
市民政局：负责及时开放紧急避险场所；指导、协助梅江区、梅县组织安置、救济受灾群众；组织核查灾情，协助发布灾情及救灾工作情况，及时向市三防指挥部提供有关灾情信息；负责组织、协调灾区救灾及受灾群众的生活救助；管理、分配有关救灾款物，并监督检查使用情况；组织开展救灾捐赠、储备救助物资等工作。
市财政局：负责落实城区防洪、除涝和抢险救灾资金，会同市有关部门分配防洪、排涝、救灾资金并监督使用。
市国土资源局：负责组织对地质灾害的应急调查和监测工作，并对灾害发展趋势进行分析预测，组织专业技术人员指导实施必要的应急处置，排除险情；协助转移与安置地质灾害危险区人员。
市住房和城乡建设局：负责做好城区建筑工地、工棚及建设项目、所属房屋的防汛防风工作；配合有关部门组织、指导居民做好房屋等民用设施的防汛防风安全工作；协助组织调集抢险队伍、抢险机械设备、防汛砂石料处置突发水利工程险情。
市交通运输局：负责做好城区公路、水运交通设施的防汛防风工作；负责抢险救灾交通保障；负责抗洪抢险救灾人员、物资的紧急运输保障。
市农业局：组织、指导城区农业防汛防风救灾工作和灾后农业、渔业救灾复产；负责农业救灾物资的储备、调剂和管理工作；组织灾区种子供应等。
市文化广电新闻出版局：落实市委宣传部有关抢险救灾宣传工作措施，组织、指导新闻宣传单位做好抢险救灾新闻宣传报道工作，及时报导灾害性天气的预警、预报以及防汛防风信息。督促、指导有关文物单位做好文物的防汛防风工作。
市卫生局：负责灾区疾病控制和医疗救治工作；组织医疗卫生应急队伍赶赴抢险救灾一线，开展医疗救治和疾病预防控制工作。
市环境保护局：负责城区饮用水源地的环境和水质监测。
市旅游局：督促、指导城区旅游景区做好防汛防风工作；根据天气情况，督促旅游区适时关闭景区游乐设施，确保游客安全。
市城市综合管理局：负责城区职责范围内市政设施的防汛防风工作，及时抢修受损市政设施；负责东山人行浮桥的防洪安全，遇洪水适时拆除浮桥；督促、指导相关单位加强对城区路树、路灯、景观照明、燃气、广告牌等设施的防汛防风工作，及时清理被强风吹倒的路树、广告牌等；及时组织清除城区街道路面杂物，防止杂物堵塞街道路面下水口；协助组织调集抢险队伍、机械设备、砂石料处置突发水利工程险情。
