副校长由理事会根据校长提名聘任。校长卸任后，副校长需由新校长提名并经理事会重新聘任。
第二十二条 校务委员会由校长、副校长、学术与行政单位负责人和教职工代表组成，设主席一名，由校长担任。校务委员会审议与学生相关事项时，应有学生代表列席。
第二十三条 校务委员会对学校教学、科研和行政管理中重大事项进行决策，具体履行以下职责：
（一）审议学校章程或章程修改草案；
（二）审议学校中长期发展规划、年度工作计划和年度工作报告草案；
（三）审议学校财务预算和决算报告草案；
（四）审议批准学校重大财务和资产处置事项；
（五）审议学校人员总额以及人力资源管理等重要制度草案；
（六）审议学术单位和行政单位设置方案及其负责人的任免，并按章程规定的程序办理；
（七）审议批准学科、专业设置，教学、科研计划，招生方案及学术委员会提交的其他各项草案；
（八）章程规定的其他职责。
校务委员会审议涉及学术事项的，应当先经校学术委员会审议通过。
第二十四条 校学术委员会成员由教授会协商产生，其中不担任行政职务的教授代表所占比例应当不少于二分之一。
第二十五条 校学术委员会负责对学校教学、科研等重大学术事项进行审议，具体履行以下职责：
（一）审议学校的学术发展规划；
（二）审议学科、专业的设置方案，教学、科研计划方案；
（三）审议教师、教辅人员的聘用、晋升及解聘事宜；
（四）组织评定教学、科学研究成果；
（五）审议其他学术事项。
第二十六条 南科大设立学术单位。学术单位负责学校内教学和科研有关事务，在学校授权范围内实行自主管理。学术单位负责人应当具有教授资格。
第二十七条 南科大设立行政单位，负责处理具体行政事务，服务教学科研工作。
第二十八条 南科大设立教授会，作为南科大教授进行学术、科研交流，参与大学管理的自治组织，负责协商产生校学术委员会成员。
