市政府督查室：负责做好专项督查工作，将综合整治任务纳入市政府年度目标考核。
市发展改革委：负责组织、督促、协调综合整治项目的实施，牵头推进生活污染治理工程前期工作，争取国家项目补助资金并及时安排下达投资计划，会同市政府有关部门督促、指导和协调综合整治工作，配合做好督查和考核工作。
市环保局：负责拟订综合整治实施工作方案，确定主城区14条次级河流水质年度目标任务，组织开展主城区次级河流水质监测，通报水质检测状况，监督、指导污染治理工程项目实施，配合做好督查和考核工作。
市城乡建委：负责牵头推进主城区次级河流流域内城市生活污水处理厂及镇、村级生活污水处理设施建设等工作。
市市政委：负责牵头主城区三级排水管网建设，完善生活垃圾收运系统建设工作，监督污水、垃圾处理项目的运营管理。
市经济信息委：牵头推进工业园区污水处理设施建设工作，出台鼓励企业入园区的优惠政策，协同市环保局负责工业污染治理工作。
市农委：负责牵头推进主城区次级河流沿岸养殖业和面源污染治理工作，会同市规划局、市环保局划定主城区畜禽禁养区、限养区、适养区范围。
市国土房管局：负责综合整治项目用地手续的办理，开辟“绿色通道”，特事特办，保障项目用地指标。
市规划局：负责项目规划手续的办理，开辟“绿色通道”，特事特办。
市财政局：负责调度、安排市级补助资金、地方债券等资金用于综合整治工作。
市工商局：负责牵头指导综合整治范围内的无工商执照企业取缔工作。
市水务集团、市水投集团、市环卫集团：负责本企业有关项目建设和运行管理。
有关区县人民政府和北部新区管委会：是综合整治工作的责任主体，负责建立本行政区域综合整治工作推进机制，筹措项目建设资金，落实责任单位和人员，倒排项目工期，按期完成综合整治任务。
附件：
主城区次级河流综合整治监督检查分组表
分组
| 牵头单位
| 组 长
| 成 员
| 督查河流分工
|
一组
| 市监察局
| 杜黎明
| 市发展改革委1人、市农委1人、市环保局1人、政协委员1人，联络员1人（市监察局）
| 栋梁河（江北区、渝北区）、肖家河（渝北区、江北区）、朝阳溪（江北区、渝北区）
|
二组
| 市政府督查室
| 何 力
| 市发展改革委1人，市市政委1人、市环保局1人、人大代表1人，联络员1人（市政府督查室）
| 大溪河（江津区、九龙坡区）、跳蹬河（九龙坡区、大渡口区）、伏牛溪（大渡口区）
|
三组
| 市发展改革委
| 汪钦琳
| 市农委1人、市监察局1人、市市政委1人、市农委1人、联络员1人（市发展改革委）
| 梁滩河（九龙坡区、沙坪坝区、北碚区）、璧北河（璧山县、北碚区）、清水溪（沙坪坝区）
|
四组
| 市环保局
| 张智奎
| 市城乡建委1人、市监察局1人、市财政局1人，环保义务监督员1人，联络员1人（市环保局）
| 花溪河（巴南区）、一品河（巴南区）、苦溪河（南岸区）
|
五组
| 市农委
| 高兴明
| 市发展改革委1人、市经信委1人、市环保局1人、环保义务监督员1人，联络员1人（市农委）
| 跳墩河（北部新区、渝北区）、盘溪河（北部新区、渝北区、江北区）
|
