（一）组织编制保税港区发展规划，报市政府批准后组织实施；
（二）组织编制产业发展目录，对投资项目和开发建设活动实施管理，管理、监督保税港区的对外贸易、转口贸易等经济活动；
（三）统一行使保税港区土地、规划、建设、环保、外经贸等各项管理职能；
（四）在行政管理体制和运行机制创新上先行先试，并制订相应的行政管理规定和实施细则；
（五）负责保税港区内信息化工作，推进保税港区内公共信息平台建设，及时发布公共信息，实现信息资源的整合与共享；
（六）会同有关行政管理部门根据国家有关产业政策调整指导意见，制订和公布保税港区产业政策导向；
（七）协调海关、检验检疫、边检、海事、港口、工商、税务、外汇管理等有关部门和其他驻区单位与保税业务有关的工作和事务；
（八）组织制订保税港区应急管理制度，建立应急处置协作工作机制，并组织协调实施；
（九）行使市政府授予的其他职权，承办市委、市政府交办的其他事项。
第六条 保税港区管委会内设保税业务管理局，负责主管全区的保税业务工作，行使日常管理职能并为企业服务，协调区内海关、检验检疫、边检、海事、港口、工商、税务、外汇管理和政府相关部门与保税业务有关的工作和事务。
第七条 保税港区的海事、港政航政管理事项，由海事、港口管理部门按照有关法律、法规、规章执行。
第八条 保税港区的治安、消防、道路交通管理等事项，由广州港公安局、广州市公安局南沙区分局在各自的管辖范围内，按照有关法律、法规、规章实施。
第三章 口岸监管
第九条 保税港区享受保税区、出口加工区相关的税收和外汇管理政策。主要税收政策为：国外货物入港区保税；货物出港区进入国内销售按货物进口的有关规定办理报关手续，并按货物实际状态征税；国内货物入港区视同出口，实行退税；港区内企业之间的货物交易不征增值税和消费税。
第十条 保税港区管委会会同有关查验单位，建立保税港区联席会议机制，制订会议规则，定期召开会议，加强信息沟通，解决实际问题，提升服务质量，提高通关效率。
