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指导交通运输行业财务、核算和内部审计工作；承担局机关和直属单位财务管理、内部审计、部门预算相关工作；负责交通建设资金和交通运输专项资金的申请、拨付及使用监管、会计核算。
(四)政策法规处(行政许可服务处)
承担交通运输行业政策研究和法制工作；指导交通运输行业体制改革工作；承担交通运输行业地方性法规、规章草案的规划和起草工作；承担交通运输法制宣传教育工作；指导、监督交通运输行业行政执法、行政复议、行政诉讼、执法监督和执法队伍建设工作；承办本部门行政复议和行政应诉工作；承担本部门规范性文件的合法性审核和备案工作；承办本部门行政许可及行政审批事项。
(五)工程科技处
承担交通建设市场监管和基础设施建设管理工作；承担交通建设单位履约行为考核和信用管理；指导交通工程质量工作，承担交通建设工程技术指导工作；组织编制交通运输行业科技与信息化发展战略、规划和计划；组织实施重大科技项目攻关、创新技术引进开发和科技成果管理；组织协调交通运输行业信息化项目建设与管理；指导交通运输行业标准计量、知识产权、技术交流、行业创新体系建设工作；指导并监督交通运输行业技术、节能减排工作。
(六)安全监督处(应急办公室)
组织拟订并监督实施公路、水路安全生产政策和应急预案，组织拟订安全规章制度；承担公路、水路安全生产综合监督的职责；指导有关安全生产体系建设，监督直属单位和县级交通运输部门安全监管工作；依法组织或参与有关事故调查处理工作，监督事故查处的落实情况；承担交通运输行业突发公共事件应急管理工作。
(七)宣传教育处
负责党的路线、方针、政策的宣传工作；指导交通运输行业新闻宣传工作，承担本部门新闻宣传工作；指导交通运输行业教育培训和文明创建工作。
(八)运输处
参与全市公路、水路、地方铁路、城市公共交通(含出租车行业)、城市轨道、民航等运输方式的综合协调工作；参与拟订综合交通运输体系规划和城市客运设施建设规划；指导交通运输服务业相关政策、技术标准和管理规范的实施；指导交通物流业的发展；参与组织、协调重点物资、紧急物资的运输保障工作。
(九)航空处
参与拟订全市民用航空发展战略、规划计划及政策；承担航空工程建设项目的跟踪管理和综合协调；对民用机场、民航企事业单位的经营行为和服务质量实施监督管理，组织协调重要航线的开辟和重大航空任务的实施；承担与上级民航、空域管理部门的沟通协调工作。
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