由国家投资建成的单村供水工程由受益区农民用水户协会负责管理，跨村供水工程由村民委员会或基层水利管理单位负责管理。
国家和社会共同投资建成的农村饮水工程，可组建股份公司负责管理。
社会投资建成的农村饮水工程，由投资者自主管理。
家庭集雨水柜、水池等分散供水工程，由受益家庭自主管理，允许继承和转让。
第九条 农村饮水安全工程建成后，经营管理单位难以落实的，由工程所在村的村民委员会负责组织成立农村供水管理协会或合作组织负责工程管护。
第十条 乡（镇）人民政府应建立和完善农村饮水安全工程管理组织，赋予其履行农村供水工程的管理职责，为农村饮水安全提供最直接、最便利的公共服务。应培育和发展农民用水合作组织，对农村饮水安全工程受益农户以民主方式组建的用水户协会，实行免费注册。
第三章 运行管理
第十一条 供水单位实行企业管理、独立核算、自主经营，对农村饮水工程安全运行负直接责任，并服从水行政主管部门的行业管理和相关部门的行政监督。村民委员会、农民用水户协会也应加强对所负责农村饮水工程的管理，确保供水质量安全。
第十二条 供水单位应当具备下列条件：
（一）符合国家有关标准规定的水源地；
（二）符合行业规范的制水工艺；
（三）供水水质达到《
生活饮用水卫生标准（GB5749－2006）》；
（四）直接从事供水管水人员须经专业技术和卫生知识培训，并经体检合格后，持相关证明上岗；
（五）严格规范的内部管理制度；
（六）建立出厂水、管网末梢水水质检测化验制度；
（七）法律、法规、规章规定的其他条件。
第十三条 供水单位及管护人员基本职责：
（一）依法保护供水工程及其设施不受损害；
（二）负责工程安全运行管理和供水设施安全与维护；
