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3.病原微生物实验室备案材料审核、管理方面：巴彦淖尔市、鄂尔多斯市卫生局在病原微生物实验室备案材料审核、管理方面还存在着职责不到位问题。
4.BSL-Ⅱ病原微生物实验室备案方面：总体备案率偏低，个别地方未开展备案工作。通辽市应备案BLS-2实验室数27个，已备案BLS-2实验室数22个，备案率为81.48%；赤峰市应备案BLS-2实验室数76个，已备案BLS-2实验室数24个，备案率为31.58%；包头市应备案BLS-2实验室数279个，已备案BLS-2实验室数46个，备案率为16.48%；乌海市应备案BLS-2实验室数21个，已备案BLS-2实验室数2个，备案率为9.52%；呼和浩特市应备案BLS-2实验室数61个，已备案BLS-2实验室数5个，备案率为8.19%；鄂尔多斯市、巴彦淖尔市备案率为“0”。
5.病原微生物实验室生物安全管理培训方面：存在组织培训不到位问题。如：鄂尔多斯市、巴彦淖尔市、通辽市、赤峰市卫生局均未组织相关培训，只要求有关各单位及辖区旗县卫生部门自行组织相关培训。
（二）医疗卫生机构
1.病原微生物实验室生物安全组织管理方面：在临河区疾病预防控制中心未见到相关材料，乌海市疾病预防控制中心、乌达区疾病预防控制中心、东胜区疾病预防控制中心、赤峰市医院、赤峰学院附属医院、乌达区中心医院的生物安全管理组织机构中职责不明确。
2.病原微生物实验室生物安全管理相关制度方面：临河区疾病预防控制中心，通辽市医院、赤峰市医院、奈曼旗医院、东胜区医院、乌拉特前旗医院、乌达区中心医院的生物安全管理制度不健全或欠规范。
3.申请备案材料方面：通辽市疾病预防控制中心、奈曼旗疾病预防控制中心、巴彦淖尔市疾病预防控制中心、包头市中心医院、包医一附院、巴彦淖尔市医院、乌海市医院病原微生物实验室生物安全申请备案材料比较规范，但需进一步加以改进，其他22家医疗卫生机构的病原微生物实验室生物安全申请备案材料均欠规范或不规范。
4.病原微生物实验室个人安全防护方面：包头市疾病预防控制中心HIV实验室做的比较差，需要立即整改，尽快符合有关要求。
5.风险评估报告及应急预案方面：除奈曼旗疾病预防控制中心符合要求外，其他28家医疗卫生机构均需进一步完善，风险评估报告及应急预案。
6.BLS-2实验室布局、流程及设施方面：除疾控机构除包头市疾病预防控制中心HIV实验室和临河区疾病预防控制中心不符合要求外，其他11家均符合要求，医疗机构中除包头中心医院、鄂尔多斯市中心医院，巴彦淖尔市医院符合要求外，其它抽查单位均不符合要求。
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