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9.建立高效规范的医药卫生机构运行机制。完善公共卫生机构运行机制。公共卫生服务机构由政府确定人员编制和经费标准，按国家政策规定确定工资水平，收支全部纳入财政综合预算。严格人员准入，建立和完善绩效考核机制和能进能出的用人制度。
建立稳定的基层医疗卫生机构运行机制。严格界定乡镇卫生院、社区卫生服务机构服务功能，规定使用适宜技术、设备和基本药物，为群众提供低成本服务。明确收支范围和标准，实行核定任务、核定收支、绩效考核补助的财务管理办法，积极探索实行收支两条线、公共卫生和医疗保障经费总额预付等多种管理办法。强化内部财务审核，严格收支预算管理，提高资金使用效益。完善内部管理，建立以服务质量和服务数量为核心、以岗位责任与绩效为基础的考核和激励制度。加强乡村医生准入和执业管理，依法开展医疗活动。按照公共卫生服务项目和考核成效，落实公共卫生补助政策。探索建立乡村医生退休和养老保险制度。
建立规范的公立医院运行机制。遵循公益性质和社会效益原则，坚持以病人为中心，优化服务流程，规范用药、检查和医疗行为。建立和完善医院法人治理结构，明确所有者和管理者的责权，形成决策、执行、监督相互制衡，有责任、有激励、有约束、有竞争、有活力的机制。推进医药分开，逐步改革以药补医现状，通过实行药品购销差别加价、设立药事服务费等多种方式逐步改革或取消药品加成政策，同时采取适当调整医疗服务价格、增加财政投入、改革支付方式等措施完善公立医院补偿机制。深化人事制度改革，实行以事业单位聘用和岗位管理制为核心的人事管理制度。完善分配激励机制，严格工资总额管理，实行以服务质量及岗位工作量为主的综合绩效考核和岗位绩效工资制度，有效调动医务人员积极性。因地制宜，因院施策，对州级医疗机构，重点发展优势学科，调整收入结构，强化监管；对县级医疗机构，重点加大投入、强化队伍、加强基本服务和推进药品零差率。对其他医院，鼓励向突出特色专科、强化惠民医疗和延伸服务方向发展。
健全医疗保险经办机构运行机制。到2011年覆盖城乡的医疗保险公共服务组织管理体系基本形成，基层服务平台和服务网络基本健全。完善内部治理结构，建立合理的用人机制和分配制度。加强基本医疗保障体系信息管理系统建设，提高医疗保险经办管理能力和管理效率。妥善解决基本医疗保障服务平台工作人员的工资待遇。
10.建立政府主导的医疗卫生投入机制。确立政府在提供公共卫生和基本医疗服务中的主导地位。明确政府、社会与个人的卫生投入责任。公共卫生服务主要通过政府投入。基本医疗服务由政府、社会和个人三方合理分担费用。特需医疗服务由个人直接付费或通过商业健康保险支付。
建立和完善政府卫生投入机制。逐步提高政府卫生投入占卫生总费用的比重，有效减轻居民个人基本医疗卫生费用负担。政府卫生投入增长幅度要高于经常性财政支出的增长幅度。政府新增卫生投入重点用于支持公共卫生、农村卫生、社区卫生和基本医疗保障。
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