县（市）区人民政府相关部门对项目区内的单项项目按照渠道不变、分别立项、综合实施、单项验收的原则，在项目的规划期内实施。
第十二条 项目区的单项项目建设任务完成后，由主管部门组织单项验收。
项目区单项验收合格后，县（市）区政府对单项验收情况进行汇总自查和初步综合验收，初步验收合格后申请市人民政府对项目区进行综合验收。市国土资源局会同市发改、农办、财政、农业、林业、水利、交通等相关部门和专家进行综合验收。
第五章 资金来源、管理和使用
第十三条 农村土地综合整治资金来源包括：土地整治专项资金（新增建设用地有偿使用费、项目耕地开垦费、用于农业土地开发的土地出让收入和土地复垦费等）、农村公路建设资金、农业综合开发资金、小型农田水利资金、退耕还林资金、中低产田改造资金、以工代赈和农业扶贫资金等相关涉农资金；建设用地指标及新增耕地指标费用；其他资金。
第十四条 农村土地综合整治项目的资金由县（市）区人民政府统一管理，财政部门负责监督，相关部门按照各类资金的规定用途规范使用。
第十五条 农村土地综合整治项目按照项目区总体预算使用各项资金。预算一经批准，不得随意更改，特殊情况确需变更的，需按原程序申报和批准方可实施。参与农村土地综合整治的部门必须设立专项资金账户，实行项目专账核算，专款专用，结余资金滚动用于农村土地综合整治项目及相关支出。
第六章 项目监管
第十六条 市人民政府组织对项目资金落实、使用情况和项目实施情况进行监督。监察、审计、财政部门应当加大工作力度，加强监督检查，杜绝违法违纪现象的发生。
县（市）区人民政府和市直相关部门应严格资金支出管理，严禁截留和挪用，确保项目资金安全。
第十七条 市直相关部门对所负责的项目进行监督管理。
第十八条 各县（市）区人民政府建立健全项目管理制度，对整体项目实施进度、工程质量、资金使用等情况进行日常监管。
第七章 考核奖惩
第十九条 建立农村土地综合整治工作考核制度，将县（市）区人民政府及市直相关部门的农村土地综合整治工作纳入绩效考核内容。
