第十六条 年审的程序：
按照年审规定的时间要求，自开票纳税人应到主管税务所领取《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08），填写盖章后连同本条下列证件和资料，一并报主管税务所。
（一）受理 时限：即时
主管税务所受理岗位对年审的纳税人发放《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08），要求其如实填写并提供下列证件和资料：
1.出示证件
（1）营业执照副本；
（2）税务登记证副本；
（3）《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》（HY03）。
2.提交资料
（1）财务报表；
（2）道路、水路运输经营许可证复印件；
（3）自有运输工具变化情况；
（4）国家税务总局或北京市地方税务局明确要求的其他资料。
受理岗位收到纳税人报送的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）及附送资料后即时核对，经审核齐全无误的，受理并填开《税务文书领取单》（HY02）交纳税人，同时将相关资料传递给初审岗位；经审核不齐全或有错误的，退回纳税人，并一次性告知其在规定期限内补齐或改正后重新报送。
受理岗位应将受理的年审资料，自受理之日起2个工作日内传递给初审岗位。
（二）初审 时限：19个工作日
主管税务所初审岗位收到受理岗位传递的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）及附送资料后，按照本规程第十五条的内容进行审核。经审核无误的签署审核意见，连同附送资料一并报送主管税务所长审批。经审批不符合条件的，在《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）上签署意见，连同附送资料一并退回受理岗位。
（三）审批 时限：21个工作日
主管税务所长对初审岗位签署意见的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）及有关资料进行审批，经批准合格的在《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）上签署意见；经审批不合格的，退回初审岗位。
（四）送达：主管税务所受理岗位收到批复的《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）及相关资料后，2个工作日内通知纳税人领取已通过年审记录的《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》（HY03），同时收回《税务文书领取单》（HY02）。
第十七条 年审结果：
（一）年审合格的处理
对年审合格的自开票纳税人，主管税务所在《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》（HY03）的年度审验记录上签署意见，加盖税务所公章。
《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》（HY03）三年更换一次，每年进行审验。
（二）年审不合格的处理
达不到自开票纳税人资格的纳税人，暂缓通过年审，由主管税务所填写《货物运输业自开票纳税人暂缓通过年审告知书》（HY09），在3个月内进行整改。整改期间，主管税务所应暂收纳税人未使用的货运发票，纳税人如需开具货运发票的，由主管税务所代开。在规定的期限内，整改合格的纳税人，按年审合格办法处理并退回暂收纳税人的发票。整改后仍不合格的纳税人，由主管税务所填写《取消自开票纳税人资格申请审核表》（HY05），取消其自开票纳税人资格，清缴货运发票，并在其税务登记证副本首页右上方空白处加盖“已取消自开票纳税人资格” （HY06）专用章，收回《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》（HY03）等相关资料，纳税人如需开具货运发票的，由主管税务所代开。
第十八条 以下情况，按年审不合格处理：
（一）纳税人必须在规定的期限内向地方税务机关办理年审手续，在规定期限内未办理年审手续的纳税人；
（二）《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）填报不实、数据不准确的，随同《货物运输业自开票纳税人年审申请审核表》（HY08）报送其他资料不齐全的，以及其他未按规定办理年审手续的纳税人，经地方税务机关责令在年审规定期内如实申报和补报，仍不如实申报和补报的纳税人。
第三章 发票及税控装置管理
第十九条 货运发票及其税控装置管理，依照《
中华人民共和国税收征收管理法》、《
中华人民共和国发票管理办法》及北京市地方税务局票证管理规定执行。
经认定具有自开票纳税人资格的纳税人方可申请购领货运发票。
第二十条 开具货运发票时应在发票联左下角加盖“财务印章”或“发票专用章”或“代开票地方税务局发票专用章”（HY10），抵扣联一律不加盖印章。自开票纳税人开具货运发票时，不再加盖开票人专章。
第二十一条 为了保证在稽核比对时正确区分收货人、发货人中实际受票方（抵扣方、运费扣除方），在填开货运发票时应首先确认实际受票方，并在纳税人识别号前打印“＋”号标记。“＋”号与纳税人识别号之间不留空格。在填开收货人及纳税人识别号、发货人及纳税人识别号、承运人及纳税人识别号、主管税务机关及代码、代开单位及代码（或代开税务机关及代码）栏目时应分二行分别填开。
第二十二条 对申请开具货运发票的代开票纳税人，应要求其填写《北京市地方税务局货物运输业代开发票申请表》（HY11）；需提交的其他资料按照票证管理部门代开发票的要求提供，先代征税款后再为其开具货运发票。
第二十三条 主管税务所在查验代开票纳税人提供的完税凭证后，为其开具货运发票，并在发票联左下角加盖“代开票地方税务局发票专用章”，将发票联、抵扣联、记账联和完税凭证交纳税人，税务所留存完税凭证复印件；已盖“代开票地方税务局发票专用章”的货运发票不再加盖原“发票专用章”。
第二十四条 提供货物运输劳务但按规定不需办理工商登记和税务登记的个人，凭个人身份证在个人车籍地由地方税务机关代开货运发票。
第二十五条 单位和个人在领取营业执照之日起30日内向主管税务所申请办理税务登记的，对其自领取营业执照之日至取得税务登记证期间提供的货物运输劳务，在办理税务登记手续后，主管税务所可为其代开货运发票。
单位和个人领取营业执照超过30日未向主管税务所申请办理税务登记的，主管税务所应按《
中华人民共和国税收征收管理法》及《
中华人民共和国税收征收管理法实施细则》的规定进行处理，在补办税务登记手续后，对其自领取营业执照之日至取得税务登记证期间提供的货物运输劳务，可为其代开货运发票。
第二十六条 以下情形主管税务所可暂停供应货运发票：
（一）在日常管理过程中经电话和实地查找方式均联系不到的；
（二）纳税人未按照规定期限进行纳税申报，且拒不接受税务机关处理的；
（三）未按税务机关规定期限报送税控数据，且拒不接受税务机关处理的；
（四）纳税人为非正常户状态的；
（五）纳税人欠缴税款，在税务机关送达《追缴欠税（滞纳金）事项告知书》后，拒不接受税务机关处理的；
（六）纳税人领购、使用发票与税控盘或传输盘报数或实际使用发票情况，以及纳税人税控盘或传输盘报数反映的发票填开情况与纳税申报情况，发现核对信息不符或有异常情况的；
（七）经过税控安全管理系统查询，发现纳税人使用税控装置或发票填开信息有异常情况的。
对出现上述情形的货运企业，主管税务所应填写《 XX 地税局 XX 税务所货运发票暂停/恢复供应审核表》（HY12）暂停供应货运发票。待问题消除或接受处理后，填写《 XX 地税局 XX 税务所货运发票暂停/恢复供应审核表》（HY12）方可恢复发票供应。在货运发票暂停供应期间，纳税人可到主管税务所代开货运发票。主管税务所应将暂停发票供应和恢复发票供应的相关信息在5个工作日内向征管部门和营业税管理部门备案。
第二十七条 对区县局、分局间转户的，原自开票纳税人认定机关应收回《货物运输业营业税自开票纳税人认定证书》（HY03），并根据征管规定，缴销已购货运发票，在办理跨区县变更税务登记手续交接材料中，注明属于转户自然终止 “公路、内河货物运输自开票纳税人”资格。转入局应根据转入信息，依申请决定是否从新进行资格认定；对办理跨区转户前已被取消自开票纳税人资格不到一年的纳税人，转出局需在办理跨区县变更税务登记手续交接材料中，注明已取消自开票纳税人资格的具体时间及取消资格原因。转入局应根据转入信息，依据本规程第十二条规定执行。
第四章 税款征收
第二十八条 对自开票纳税人开具的货运发票注明的运费和其他价外收费，一律按“交通运输”税目征收营业税。
第二十九条 自开票纳税人的营业额为纳税人提供货物运输劳务收取的全部价款和价外费用。但是，下列情形除外：
自开票纳税人将承揽的运输业务分给其他单位或者个人的，以其取得的全部价款和价外费用扣除其支付给其他单位或者个人的运输费用后的余额为营业额。
第三十条 本规程第二十九条规定，支付给其他单位或者个人的运输费用，准予抵扣的运费结算凭证，是指货运发票、国际海运业运输专用发票、国营铁路、民用航空运输单位开具的货票、从事货物运输的非国有运输单位开具的套印全国统一发票监制章的货票，以及国家税务总局规定的其他合法有效凭证。
第三十一条 自开票的物流劳务单位开展物流业务应按其收入性质分别核算，提供运输劳务取得的运输收入按“交通运输业”税目征收营业税并开具货运发票；提供其他劳务取得的收入按“服务业”税目征收营业税并开具服务业发票。
凡未按规定分别核算其应税收入的，一律按“服务业”税目征收营业税。
代开票单位在为代开票物流劳务单位代开发票时也应按照以上原则征税（代征）并代开发票。
第三十二条 自开票纳税人以货运发票的记帐联作为公路货物运输应纳印花税的凭证，实行汇总缴纳。
第三十三条 代开票单位代开货运发票时，应向代开票纳税人征收以下税费。
（一）营业税
对代开票纳税人在代开货运发票时一律按开票金额3%征收营业税。其计征营业税的营业额为代开的货物运输业发票注明营业税应税收入，不得减除支付给其他单位或者个人的各种费用。
代开票纳税人提供运输劳务的同时提供装卸搬运、仓储、保险等其他劳务的，应按其收入性质分别开票，对提供运输劳务取得的运输收入开具货运发票，按“交通运输业”税目征收营业税，其中的装卸搬运收入，可开具在货运发票“其他项目及金额”栏内，按“交通运输业”税目征税；对运输货物进行挑选、整理、包装、仓储等劳务取得的收入开具服务业发票，按“服务业”税目征收营业税。凡未按规定分别核算其应税收入的，一律按“服务业”税目征收营业税。
（二）城建税、教育费附加
除外商投资企业和外国企业外，按营业税税款7%预征城建税，按营业税税款3%征收教育附加费。
（三）企业所得税或个人所得税
按2.5%的征收率计算征收，预征的所得税年终时进行汇算清缴。
（四）印花税
代开票纳税人须按1‰汇总缴纳承、托运双方应纳的印花税。代开票单位代扣印花税税款时，在货运发票的记帐联和发票联分别加盖“印花税代扣专用章”（HY13），作为承、托运双方应纳印花税完税凭证。
在代开票时已征收的属于法律法规规定的减征或者免征的营业税及城市维护建设税、教育费附加、所得税以及高于法律法规规定的城市维护建设税税率的税款，在下一征期退税。
第三十四条 由国家税务机关负责征收管理企业所得税，但由地方税务机关负责代开货物运输发票并统一代征税款的货物运输业代开票纳税人，其按照法律法规规定应退的企业所得税，退税事项由主管国家税务机关办理，可直接抵缴该纳税人次年应纳企业所得税，也可在汇算清缴后办理退税，退税额不超过纳税年度主管国家税务机关对其已征的企业所得税税额；超出主管国家税务机关已征部分由地方税务局办理退税事项的，主管国家税务机关应当填制“汇算清缴情况说明”（HY14）并将应退信息及时传送给主管税务所。纳税人的退税事项在每年汇算清缴时予以结算办理。
第三十五条 主管税务所应按照减免税条件的要求，对符合享受减免税条件的自开票纳税人所开具的货运发票减免征收营业税；对符合享受减免税条件的代开票纳税人，在代开货运发票时即时征收营业税、城建税、教育费附加及所得税，再按规定办理退税；对给予了减免营业税优惠的自开票纳税人和代开票纳税人，同时要加强其日常监督、检查。
第五章 开票信息采集及纳税申报“票表比对”
第三十六条 自开票纳税人、代开票中介机构，应在每月15日前使用税控盘或传输盘向主管税务所报送上月开票数据。如上月未开具货运发票或抵扣营业额的自开票纳税人、代开票中介机构，仍须于每月15日前报送相关信息及资料。自开票纳税人需同时报送，所属期内申报缴纳营业税抵扣营业额的《营业税运输发票抵扣清单》HY15。
