第五条 县级以上国土资源、农业、发改委、财政、监察、环境保护、林业、水利等部门应当按照各自职责，加强协作配合，共同做好基本农田保护工作。
第六条 市、县人民政府要按照《市县乡土地利用总体规划（2006年-2020年）》的要求，科学划定基本农田，并可多预留5%的基本农田用于不易确定具体的建设项目占用，占用规划多预留的基本农田，不视为调整规划。基本农田一经划定，实行永久保护，不得擅自调整，不得随意改变区位。
第七条 县级以上人民政府应当与下一级人民政府签订基本农田保护责任书；乡（镇）人民政府应当与村民委员会或农村集体经济组织签订基本农田保护责任书。
第八条 乡（镇）人民政府应当履行基本农田保护职责，协助上级各职能部门做好基本农田保护工作。
村民委员会或农村集体经济组织应当加强对本区域基本农田的保护，及时制止和报告损害基本农田的行为。
第三章 保护与建设
第九条 任何单位和个人不得擅自改变或占用基本农田以及基本农田保护区内的水利设施、水源工程和对基本农田保护区进行引水灌溉的河道、渠道、管道、水源工程，因公共利益需要确需占用基本农田的，须报经国务院批准。
因公共利益需要，确需占用基本农田的，在报国务院批准前，由县级人民政府拟定实施方案，补划数量和质量相当的基本农田，并在拟征收土地所在地的乡（镇）、村予以公告，公示所占用基本农田的位置、范围、面积和地类等级等信息，并组织听证，充分听取农村集体经济组织、农民和社会各界的意见，保证其陈述意见、质询和申辩的权利。
第十条 禁止任何单位和个人闲置、荒芜基本农田。经批准占用基本农田的，闲置一年未动工建设的，由国土资源部门按规定收取闲置费；可以耕种并收获的，须恢复耕种；连续二年未使用的，经批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权，并交由原农村集体经济组织恢复耕种，重新划入基本农田保护区。
第十一条 承包经营基本农田的单位和个人连续二年弃耕抛荒的，原发包单位应当终止承包合同，收回发包的基本农田，并组织恢复耕种，也可以由原发包单位组织代耕，代耕收入及国家的各种补贴归代耕者所有。
