有免税购进原材料业务的企业应扣除“免抵退税不得免征和抵扣税额抵减额”。当“免抵退税不得免征和抵扣税额抵减额”大于“出口货物销售额乘征退税率之差”时，“免抵退税不得免征和抵扣税额”按0填报，其差额结转下期。
在计算“免抵退税不得免征和抵扣税额抵减额”时，进料加工免税进口料件组成计税价格按“购进法”计算，为当期全部购进的进口料件组成计税价格。
（3）“免抵退货物应退税额”按照主管区、分局（基层分局）当月已审批确认并销号的《生产企业出口货物免、抵、退税申报汇总表》中的“当期应退税额”填报。
3.《生产企业出口货物免、抵、退税申报明细表》的申报要求
（1）企业按当期在财务上做销售的全部出口明细填报《生产企业出口货物免、抵、退税申报明细表》，对单证不齐无法填报的项目暂不填写，并在“单证不齐标志栏”内按填表说明做相应标志。
（2）对前期出口货物单证不齐，当期收集齐全的，应在当期免抵退税申报时一并申报参与免抵退税的计算，可单独填报《生产企业出口货物免、抵、退税申报明细表》，在“单证不齐标志栏”内填写原申报时的所属期和申报序号。
4.《生产企业出口货物免、抵、退税申报汇总表》的申报要求
（1）“出口销售额乘征退税率之差”按企业当期全部（包括单证不齐全部分）免抵退出口货物人民币销售额与征退税率之差的乘积计算填报；
（2）“免抵退税不得免征和抵扣税额抵减额”按各主管区、分局（基层分局）当期审核的《生产企业进料加工贸易免税证明》中的“免抵退税不得免征和抵扣税额抵减额”与根据“国内购进免税原材料”计算的“免抵退税不得免征和抵扣税额抵减额”之和填报；
（3）“出口销售额乘退税率”按企业当期出口单证齐全部分及前期出口当期收齐单证部分且经过各区、分局（基层分局）审核确认的免抵退出口货物人民币销售额与退税率的乘积计算填报；
（4）“免抵退税额抵减额”按各区、分局当期开具的《生产企业进料加工贸易免税证明》中的“免抵退税额抵减额” 与根据“国内购进免税原材料”计算的“免抵退税额抵减额” 之和填报。
5.申报数据的调整
对前期申报错误的，当期可进行调整。前期少报出口额或低报征、退税率的，可在当期补报；前期多报出口额或高报征、退税率的，当期可以红字（或负数）差额数据冲减；也可用红字（或负数）将前期错误数据全额冲减，再重新全额申报蓝字数据。对于按会计制度规定允许扣除的运费、保险费和佣金，与原预估入帐值有差额的，也按此规则进行调整。
出口货物发生退运的，可在退运当期用红字（或负数）冲减出口销售收入进行调整。
（四）延期申报
生产企业出口货物纸质退税凭证丢失或内容填写有误，按有关规定可以补办或更改的，或确有特殊原因无法按时申报的，或有其他书面合理理由的，可在规定的申报期限内，向各主管区、分局（基层分局）提出延期办理出口货物退（免）税申报的申请（见附件11），经各主管区、分局（基层分局）核准后，可最长延期3个月申报办理退（免）税。
特殊原因是指：
1.因不可抗力致使无法在规定的期限内取得有关出口退（免）税单证或申报退（免）税。
2.因采用集中报关等特殊报关方式无法在规定的期限内取得有关出口退（免）税单证；特殊报关方式应包括集中报关、港口报关、通过监管仓出口等方式。
3.因经营方式特殊无法在规定的期限内取得有关出口退（免）税单证。“经营方式特殊”应包括：（1）出口需要测试、安装产品，合同约定分期付款的；（2）其他特殊经营方式。
六、新发生出口业务的生产企业“免、抵、退”税管理
自发生首笔出口业务之日起未满12个月的生产企业是新发生出口业务的企业，其退税审核期为12个月。在此期间出口的货物，应按统一的按月计算免、抵、退税的办法分别计算免抵税额和应退税额。税务机关对审核无误的免抵税额可按现行规定办理调库手续，对审核无误的应退税额暂不办理退库。对新发生出口业务的企业的应退税款，可在退税审核期期满后的当月对上述各月的审核无误的应退税额一次性退给企业。
新发生出口业务的生产企业，符合下列条件的，可申请按月办理免、抵、退税：
注册开业时间在一年以上的新发生出口业务的企业，经企业提出申请，各主管区、分局（基层分局）核实其确有生产能力并无偷税行为，并在向海关、外汇管理部门发出《关于核实进出口货物有关情况的函》（附件12）和《关于核实外汇核销有关情况的函》（附件13），核实其无走私、逃套汇等违法行为的，可由各主管区、分局（基层分局）通过正式文件逐级报深圳市国家税务局审批，经批准后，可实行统一的按月办理免、抵、退税的办法。
