重点流域区域环境综合整治项目申报材料须有整体项目信息表、可行性研究报告及批复、环境影响评价报告及批复，符合专项资金使用范围建设内容的实施方案、建设项目信息表等。
（三）申报指标及个数
环境综合整治项目，由各县（市）根据本地实际情况向市（州）申报，由市（州）财政和环保部门组织审核后汇总上报，每个市（州）申报项目不超2个，直管市、神农架林区申报1个。省直管燃煤电厂脱硫项目经当地财政、环保部门签署意见后直报省财政厅和省环保厅，不占当地申报项目个数。
二、建设社会主义新农村小康环保行动项目
2010年度建设社会主义新农村小康环保行动项目继续围绕农村环境保护“两清”、“两减”、“两治”、“两创”示范模式，重点支持村庄环境综合整治、清洁种植与养殖示范、生态示范创建及鄂西圈环“一江两山”生态景观建设项目。
（一）村庄环境综合整治项目
重点支持农村生活污水和垃圾处理项目。城市周边的村庄，污水纳入城市污水收集管网统一处理；规模较大村庄通过建设集中污水处理设施，处理生活污水；居住比例分散、经济条件较差村庄，采取分散式、低成本的小型人工湿地、微动处理、氧化塘等方式处理生活污水。生活垃圾处理项目主要支持“户分类、组保洁、村收集、镇转运、县处理”的城乡一体化处置模式，专项资金主要用于垃圾分类、收集、转运设施；对个别经济欠发达、交通不便地区，可支持采取堆肥、填埋等方式进行处理。
村庄环境综合整治项目由村庄所在乡镇提出申请，报县（区、市）级人民政府同意后，由县财政和环保部门联合报市（州）财政和环保部门，经市（州）组织审核汇总后联合上报。
村庄环境综合整治项目申报材料包括专项资金申请报告，项目投资预算明细表、地方政府配套资金和按期完成治理目标的承诺函。申请报告重点要突出项目整治单元的主要环境问题、采取的整治措施、完成时间、预期治理目标等。
已经纳入中央农村环境连片整治示范的地区，原则上不申报村庄环境综合整治项目，按省里统一布置进行。
（二）种植业和养殖业清洁生产示范项目
1.种植业清洁生产示范项目
按照高产、优质、高效、生态、安全的要求，以有机食品基地建设为载体，支持采取综合措施控制农业面源污染、化肥减量增效及农药减量示范等种植业清洁生产示范项目。
