三、内设机构
根据上述职责，市畜牧兽医局设7个职能处室。
（一）办公室
组织协调局机关日常工作；负责局机关文电、会务、机要、档案、安全、保密、信息、督查、信访、应急管理、政府信息公开和市政府市民服务热线办公室转办事项的办理等工作；负责局机关综合性文稿的起草工作；负责相关人大代表建议和政协委员提案的办理工作；起草有关地方性法规、规章草案，负责行业行政执法工作；负责畜牧业对外经济技术交流与合作；负责畜牧兽医事业费和专项经费的管理及相关统计、审计和国有资产监管工作；负责畜牧业建设项目的汇总、上报和计划下达；依法指导、扶持涉牧农村合作经济组织的建设与发展。
（二）组织人事处
负责局机关和直属单位的组织人事管理、机构编制工作；组织、指导系统教育培训工作；负责局机关离退休人员的管理服务工作，指导局直属单位离退休人员的管理服务工作。
（三）畜牧科技处
拟订畜牧业生产发展的政策并组织实施；组织、指导畜牧业产业化建设；按规定负责畜禽养殖项目的筛选、实施和管理；负责种畜禽管理工作，指导畜禽良种繁育体系建设；组织、指导畜牧兽医行业科技工作。
（四）动物卫生防疫处
拟订动物防疫、检疫的政策并组织实施；指导、监督全市动物防疫、检疫工作；拟订动物疫病防治计划并组织实施，组织实施全市重大动物疫病防控工作；按规定负责动物防疫、检疫项目的筛选、实施和管理；负责无规定动物疫病区的建设和动物防疫管理工作。
（五）医政药政处
拟订兽药、兽医器械管理的政策并组织实施；负责兽医生物实验室的生物安全监督工作；指导官方兽医、执业兽医管理工作；负责兽药、兽医器械、动物诊疗机构的监督管理；组织拟订和实施全市兽药产品质量抽检计划、动物及动物产品兽药残留监控计划。
（六）饲料管理处
拟订饲料、饲料添加剂管理及草场保护、建设的政策并组织实施；负责饲料、饲料添加剂、饲料生产企业、动物源性饲料产品、草场和草种监督管理工作；负责全市饲草饲料资源的保护及开发利用；负责饲料及饲料添加剂、牧草项目的筛选、实施和管理。
（七）畜产品质量安全监管处（挂市奶业管理办公室牌子）
拟订畜产品质量安全管理的政策并组织实施；负责畜产品质量安全监督管理和重大畜产品质量安全事故处置工作；负责制定并组织实施畜禽质量安全检测计划；组织、指导对畜牧业投入品的监督管理；按职责分工承担无公害畜产品管理有关工作。
