省级、市级国税机关对专用发票限额管理工作进行监督检查。
五、业务流程
（一）企业申请
企业根据申请条件，提报相关申请材料向当地主管税务机关提出专用发票限额使用、变更等申请；
（二）受理申请
由办税服务厅负责专用发票限额核定申请的受理工作，并当场核对企业申请材料的完整性，经核对一致且申请材料齐全，当场受理，制作《文书受理回执单》，将有关资料的原件退还纳税人。对申请材料不齐全或者不符合填列要求的，应当当场告知纳税人需要补正的全部内容。
主管税务机关应当自受理企业书面申请报告之日起3个工作日内将纳税人申请材料移交税源管理单位进行实地核实。
（三）实地核实
由税源管理单位负责进行实地核实，主要核实企业申请材料的真实性，并自收到申请材料之日起10个工作日内出具实地核实报告。实地核实时应当有两名或者两名以上税务机关工作人员同时到场，核实的主要内容有：
1、企业基本情况，包括企业书面申请报告是否与企业实际情况一致，年增值税应税销售额是否达到规定标准，注册地与实际经营地是否一致；
2、实地查验实际库存货物情况，对属于异地存放的，应由企业提供货物存放的有关证明材料；
3、企业申请调高专用发票限额的原因，是否有相关合同、协议或已认证的进项发票原件等；
4、主管税务机关认为需要重点核实的其他内容。
（四）核定审批
增值税业务管理部门负责专用发票限额核定审批的管理工作， 要求做到程序规范、资料齐全、据实核定、严格审批，并自受理企业书面申请报告之日起的第20个工作日内做出专用发票限额审批决定。在第20个工作日内不能做出决定的，经本级国税机关负责人批准，可以延长10个工作日，并将延长时限的理由书面告知申请企业。审批结果为：予以批准、不予批准和延缓（暂缓）批准等。做出予以批准的，向申请企业颁发、送达《准予行政许可决定书》；做出不予批准和延缓（暂缓）批准的，应当将不予批准和延缓（暂缓）批准理由书面告知纳税人；
（五）信息维护
最高开票限额批准后，先由发票发售部门负责对CTAIS系统中专用发票限额核定信息进行录入、调增、调减等维护工作；后传递到防伪税控发行部门，对企业防伪税控系统发行信息进行调整。信息维护工作应在5个工作日内完成。
