建立新基因发掘、分子生物学基础研究、分子育种等研发设施，开发重要性状基因的实用分子标记，改良分子标记检测技术，提高规模化应用水平，构建高效的分子育种技术体系，提高育种效率，突破规模化发掘种质资源中优异基因的技术瓶颈，实现多目标重要性状的定向改良，提高我国主要粮食作物育种效率。
　　8、作物细胞育种国家工程实验室
　　建立染色体工程技术、细胞工程技术、分子细胞工程技术、单倍体工程技术等研发设施，开展植物体细胞和配子细胞培养高频率再生及无性系变异技术、远缘体细胞融合技术、细胞定向突变筛选技术、染色体工程诱导异源染色体易位及其快速识别技术等研究，培育优质、抗逆、抗病的育种新材料，满足主要园艺作物新品种培育的需求。
　　9、林木育种国家工程实验室
　　建立基于分子水平的林木种质研发平台，开展林木速生、木材形成、高抗等功能基因的快速发现和鉴定技术，高效多基因转化技术，高密度、高精度遗传图谱构建关键技术，困难树种再生体系及针叶树的体胚转化系统，林木新种质性状快速鉴定技术等研究，提高我国林木育种水平，满足工业用材林及生物质能源林建设的需求。
　　10、动物育种国家工程实验室
　　建立动物遗传基因资源发掘评价、分子育种、繁殖技术等研发平台，开展优异基因资源大规模发掘和有效利用技术，经济性状新型分子标记开发和辅助育种技术，胚胎规模化生产技术，体细胞克隆技术，优质、抗病、特色转基因畜禽育种技术等研发，满足我国畜禽和特色经济动物养殖的需求。
　　11、现代酶工程国家工程实验室
　　建立工业化发酵控制技术、低成本分离技术、先进的发酵废液后处理技术研发平台，开展工业酶发现、改造、规模化表达、制剂制备等关键和共性技术研发，制定和完善相关行业的酶制剂技术标准，加快酶制剂产业的发展，促进其在能源、饲料、食品、环境、医药等工业领域的应用。
　　12、生物质化学利用国家工程实验室
　　建立生物质热化学转化和非木质资源绿色合成工程化研发平台，重点突破生物质热化学转化定向制备燃气、合成气，生物质液化制备生物基化学品，生物质化学改性及树脂化技术，非木质生物质资源绿色高效转化合成生物基材料等工程化关键技术，为我国生物质资源的高效利用提供有效支撑。
　　13、动物用生物制品国家工程研究中心
　　围绕保障畜牧业健康发展和公共卫生安全，建立动物用生物制品技术的系统集成和工程化验证平台，加强动物疫苗、诊断制剂、血清等生物制品的技术创新和产业化，重点解决典型毒株分离、疫苗免疫接种控制、基因工程活载体疫苗等生产技术和工艺难题，发展新型分子检测技术，构建相应的质量标准体系和技术咨询服务体系，全面提升动物用生物制品生产的技术水平和生产规模。

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