肉蛋奶等养殖产品与人民群众的日常生活息息相关，其供应状况关乎国计民生和社会稳定，应给予优先发展。但是，由于饲料养殖业的产品附加值一般低于玉米深加工业，在原料竞争中往往处于劣势。如何保证饲料养殖业对玉米原料的需求，从而保障国家食物安全，是玉米深加工业发展需要处理好的重大关系。
二、指导思想和基本原则
（一）指导思想
贯彻落实科学发展观，按照全面建设小康社会和走新型工业化道路的要求，以保障国家食物安全和提高资源利用效率为前提，以满足国内市场需求为导向，严格控制玉米深加工盲目过快发展，合理控制深加工玉米用量的增长速度和总量规模，优先保证饲料加工业对玉米的需求，促进玉米深加工业健康发展；推进玉米深加工业结构调整和产业升级，提高行业发展总体水平；优化区域布局，形成重点突出、分工明确、各有侧重的发展格局；推动产业化经营，引导优质专用玉米基地建设，反哺农业生产；发展循环经济，延伸资源加工产业链，提高综合利用水平。
（二）基本原则
一是控制规模，协调发展。严格控制玉米深加工项目盲目投资和低水平重复建设，坚决遏制过快发展的势头，使其发展与国内玉米生产能力相适应。
二是饲料优先，统筹兼顾。在充分保证饲料养殖业、食用和生产用种对玉米需求的基础上，根据剩余可用玉米数量适度发展深加工业，确保饲用、食用和生产用种玉米供应安全。
三是合理布局，优化结构。优化饲料加工业和玉米深加工业布局，在确保东北地区及内蒙古作为商品玉米产区地位不动摇的前提下，积极发展饲料加工业，适度发展深加工业。
四是立足国内，加强引导。玉米加工产业发展应以满足
国内市场需求为基本思想，加强对玉米初加工及部分深加工产品出口的必要控制，避免加剧国内玉米资源的短缺局面。同时，鼓励适度进口一定数量的玉米，以满足国内市场需求。
五是循环经济，综合利用。坚持循环经济的理念，加快玉米深加工业的结构调整，坚持上规模上水平，提高资源利用水平和效益，减少污染物排放，降低单位产品能耗、物耗。
三、总体目标
通过政策引导与市场竞争相结合，加快产业结构、产品结构和企业布局的调整，淘汰一批落后生产力，提高自主创新能力，提升行业的技术和装备水平，形成结构优化、布局合理、资源节约、环境友好、技术进步和可持续发展的玉米加工业体系。“十一五”时期主要目标如下。
--保持协调发展。“十一五”时期饲料玉米用量的年增长率保持4.7%左右；控制深加工玉米用量的增长，保持基本稳定。
--用粮规模控制在合理水平。玉米深加工业用粮规模占玉米消费总量的比例控制在26%以内。
--区域布局更加合理。以东北和华北黄淮海玉米主产区为重点，加强玉米生产基地和加工业基地建设。到2010年东北三省及内蒙古玉米输出总量（不含出口）力争不低于1700万吨，输出总量占当地玉米产量的比重不低于30%。
--产业结构不断优化。企业规模化、集团化进程加快，资源进一步向优势企业集中，骨干企业的国际竞争力明显增强。
--基本建立起安全、优质、高效的玉米深加工技术支撑体系和监管体系，可持续发展能力增强。
--玉米利用效率显著提高，副产物得以综合利用，产业链不断延长。到2010年，深加工单位产品原料利用率达到97%以上，玉米消耗量比目前下降8%以上。
--资源消耗逐步降低，污染物全部达标排放。单位产值能耗降低20%，单位工业增加值用水量降低30%，玉米加工副产品及工业固体废物综合利用率达到95%以上，主要污染物排放总量减少15%。
四、行业准入
