上述中央财政决算收支数，与2007年3月向人代会报告的2006年中央预算执行数比较，中央财政总收入增加11．58亿元，主要是决算清理期间地方上解收入及其他收入增加；中央财政总支出增加10．59亿元，主要是决算清理期间增加安排社会保障等支出。
2006年年末，中央财政国债余额控制在 35380．69亿元的限额以内。2006年，中央政府性基金收入1707．01亿元，中央政府性基金支出 1707．01亿元。
中央财政运行的主要情况如下：
(一)扎实实施稳健财政政策，不断壮大经济财政实力
2006年，继续实施“控制赤字、调整结构、推进改革、增收节支”为主要内容的稳健财政政策，促进国民经济保持平稳较快发展。在此基础上，各级财政、税务、海关等部门依法加强收入征管，财政收入实现较快增长，中央财政本级收入 20456．62亿元，占全国财政收入的52．8％，主要收入项目完成情况是：增值税9588．43亿元，消费税1885．69亿元，营业税160．54亿元，企业所得税4358．46亿元，个人所得税1472．17亿元，进口产品消费税、增值税和关税6104．42亿元，外贸企业出口退税4877．15亿元，车辆购置税 687．46亿元，以上收入项目都较好地完成了预算。受一些因素影响，与预算相比部分收入项目变化较大。其中，证券交易印花税174．09亿元，完成预算的232．1％，主要是2006年证券市场渐趋活跃，交易金额大幅增加；其他收入894．01亿元，完成预算的180．6％，主要是根据国务院决定，自2006年3月26日起开征石油特别收益金，共计征收372亿元。财政收入形势好主要是经济形势好的反映，但也存在一次性、政策性和超常规因素所带来的增收。总的看，财政收入增长机制渐趋完善，财政发展具有一定的稳定性和协调性。
中央财政实际比预算超收2585亿元(未扣除解决出口退税历史陈欠)。按照党中央、国务院的统一部署和安排，根据《
预算法》、《
全国人民代表大会常务委员会关于加强中央预算审查监督的决定》及十届全国人大四次会议有关决议的要求，中央财政超收收入除按有关法律、法规和财政体制规定，增加对地方税收返还和一般性转移支付 231亿元、增加教育支出16亿元外，主要用于加强经济社会发展的薄弱环节、解决历史欠账和削减财政赤字，没有用于增加一般性开支。具体是：增加社会保障支出247亿元；增加石油特别收益金专项支出372亿元，用于对农渔林等行业因油价上涨增支的补助，以及能源开发、节能、环保等方面的重大项目支出；增加预算内经常性投资 100亿元，主要用于支持社会主义新农村建设；增加专项支出135亿元，用于公路建设、购置储备油和大中型水库移民后期扶持；增加“三奖一补”资金、对西藏农牧民补助、缉私经费补助、口岸专项转移支付35亿元；增加出口退税指标613亿元，用于解决剩余出口退税历史陈欠，减少中央财政赤字201．04亿元；预留2007年调整工资及相关支出135亿元，安排500亿元建立中央预算稳定调节基金。2006年中央财政预计超收收入安排使用的情况，国务院已向全国人大常委会报告。
