--培育40个左右主要农作物主导品种，新品种增产潜力提高10%以上，保障粮食综合生产能力在5.0亿吨左右；培育15个左右主要畜禽、水产养殖新品种（系），畜禽和水产新品种增产潜力分别提高10%和15%；动植物新品种产品品质明显改善，自主供种能力大幅提高；培育一批高产、高能量、广适性、低成本的能源作物新品种。
--主要农产品深加工比例提高到40%，农产品加工业总产值与农业总产值之比提高到1.5：1。
--开发先进实用智能化农业技术装备10～15项，耕种收综合机械化水平提高9个百分点，综合生产效率显著提高。
--主要农作物病虫害损失率由8%下降到5%；猪、牛、羊、禽的病死率由8%、2%、4%和18%下降到5%、1%、3%和12%以下；水产业病害损失率降低8%。
--主要农区耕地退化率下降10个百分点，农田地力等级普遍提高1～2级；农业灌溉用水有效利用系数提高到0.5，肥料、农药等资源利用率分别提高3个百分点；秸秆饲用率提高到40%。
--推广农业标准化生产技术，基本实现食用农产品无公害生产；示范区畜禽粪便、生活垃圾和污水、农作物秸秆资源化利用率达到90%以上。
--建设100万个科技示范户，培训农民5亿人次，培养有文化、懂技术、会经营的新型农民；重点区域主导品种、主推技术入户率达到90%以上。
--建设“三电合一”农业综合信息服务平台，信息服务覆盖面达到2000个县，覆盖率达到农业市县的90%以上，受益农户达到1.6亿户。
三、农业科技发展的重点任务
（一）中长期重点任务
重点开展农业生物遗传改良和农业可持续发展等科学问题的基础研究，如重要农业生物基因和功能基因组及相关“组”学，高效规模化农作物、畜禽、水产转基因技术体系，生物多样性与新品种培育的遗传学基础，植物抗逆性及水分养分和光能高效利用机理，农业生物与生态环境的相互作用，农业生物安全与主要病虫害控制原理等。
重点开展事关现代农业发展全局性、战略性、关键性的重大核心技术研究，如种质资源发掘、保存和创新与新品种定向培育，畜禽水产健康养殖与疫病防控，农产品精深加工与现代储运，农业生物质综合开发利用，农业生态安全，环保型肥料、农药创制和生态农业技术，多功能农业装备与设施，农业精准作业与信息化，现代奶业，农产品质量安全、转基因生物新品种培育及主要农作物规模化制种技术等。
（二）“十一五”期间重点任务
1．组织农业科研攻关
在瓶颈性与紧迫性的科技领域超前部署，在一些农业应用基础与前沿高技术领域开展自主创新，形成自主知识产权成果，构筑现代农业发展的技术高地。
--新一代动植物新品种培育。重点研究动植物遗传种质资源保护与利用技术，应用常规技术、转基因技术、分子定向育种技术以及航天诱变育种技术等，培育动植物新品种。特别是在超级稻、优质专用小麦、高产多抗玉米、转基因杂交抗虫棉、优质多抗蔬菜、高油油菜、杂交大豆等方面取得较大突破；在猪、牛、羊、禽和水产等具有自主知识产权的优质种培育上取得明显进展；在出口创汇型经济动植物的特色种培育上取得明显成效。
--农产品质量安全和监控。重点突破高效、安全农业生物制剂创制技术、无害化生产关键技术、标准化生产技术以及农产品质量安全检测、农产品和环境中化学污染物快速在线检测等检验检测技术，创制一批具有自主知识产权和重要应用前景的基因工程疫苗、生物农药、新型肥料、生物饲料添加剂新产品；研制一批阻隔、诱杀防虫和设施避雨、控湿防病等无害化生产关键技术；构建基于抗原－抗体反应的污染物快速在线检测技术体系，开发相应的技术产品及检验检测设备。
--高产高效种养技术与农作制度。重点突破大面积单产均衡增长的栽培理论，研究开发不同生态区域主要农作物轻简栽培和基于“个性化”的高产栽培技术体系，研究设施连作障碍治理技术，研究开发区域农业生产物质要素、技术优化组合及科学配置模式；研究开发不同区域、不同饲养规模畜禽和水产高效健康养殖模式与技术体系；研究开发养殖高效节粮、节能减排新技术、新材料、新工艺，开发海洋牧场营造技术、工程建设资源与生态危害量化评估技术。
