总之，在全面建设小康社会、加快现代化建设的新的发展阶段，要抓住我国经济社会发展的重要战略机遇期，必须深入贯彻科教兴国战略和人才强国战略，大力加强自主创新基础能力建设，为加快经济增长方式转变、产业结构优化升级和突破人口资源环境等瓶颈制约提供有力支撑。
二、指导思想与建设目标
（一）指导思想。
坚持以科学发展观为指导，贯彻“自主创新、重点跨越、支撑发展、引领未来”的科技发展方针，按照“着眼长远发展、优化整体布局、完善体制机制、提升创新能力”的总体原则，体现高水平、不重复、促进资源共享、军民结合的要求，统筹规划国家自主创新基础能力建设，为将我国建设成为创新型国家提供必要的物质技术基础。
“着眼长远发展”就是要突出自主创新基础能力建设的前瞻性，在体系设计上要按照《科技规划纲要》的部署，充分考虑长远发展需要，在具体建设重点选择上要满足“十一五”发展的迫切要求。
“优化整体布局”就是要突出自主创新基础能力建设的系统性，从完善国家创新体系的高度提出对自主创新基础能力建设的战略需求，从完善创新链条、支撑中长期重大战略任务出发，优化自主创新基础设施的整体布局，充分发挥中央、地方和各方面的积极性。
“完善体制机制”就是要突出自主创新基础能力建设的开放性，充分发挥市场配置资源的基础性作用和公共财政投入的引导作用，鼓励社会资本投入自主创新基础设施建设，坚持共建、共享、共用原则，有效支撑自主创新。
“提升创新能力”就是要突出自主创新基础能力建设的战略性，面向国家战略需求和世界科学技术前沿，提升我国原始创新能力、集成创新能力和引进消化吸收再创新能力。
（二）建设目标。
“十一五”期间，通过自主创新支撑体系的建设和发展，将实现以下主要目标：
--原始创新能力有较大提升，基础科学研究、战略高技术研究的支撑条件得到强化，科技引领经济和社会发展的能力进一步增强。
--集成创新能力显著增强，产业关键共性技术研发、系统集成和工程化条件比较完善，对产业结构调整的支撑和带动能力有效提升。
--引进消化吸收再创新能力取得重大突破，在重大技术装备研制和重点工程设计等方面引进技术消化吸收和再创新的研究试验设施显著增强，对重点工程和重大任务的保障能力大幅提高。
--企业技术创新主体地位全面强化，企业研发条件和创新环境明显改善，形成一批拥有自主知识产权和知名品牌、国际竞争力较强的优势企业。
--高层次创新人才大量涌现，为人才的培养和使用创造良好的环境与条件，培养、吸引、凝聚一大批优秀科技人才，尤其是学科和产业技术带头人。
