发展乡镇企业要坚持以农为本，依靠农民，充分调动农民的积极性和创造性。积极为拓宽农民就业渠道、增加农民收入、提高农民素质、改善农民生活条件、维护农民权益提供服务。按照建立全国统一市场的要求，规范和维护市场经济秩序，优化配置资源，统筹城乡和区域发展。
二、坚持市场主导、政府服务的原则
发展乡镇企业要遵循市场规律和经济规律。政府应通过制定和实施法律法规政策，为乡镇企业提供公共服务，为乡镇企业发展创造良好的制度环境和政策环境。乡镇企业发展什么样的产业、生产什么样的产品和采取哪一种经营方式，都应由其根据市场需求和国家产业政策自主决定。
三、坚持分类指导、突出特色的原则
发展乡镇企业要因地制宜，发挥优势，突出特色。各地要根据自身的资源禀赋特点和发展水平，自主确定主导产业和特色产品。在政策指导和规划安排上不搞“一刀切”。乡镇企业发展慢或刚起步的地区，要以发展为主，在发展中提高；乡镇企业发展已有较好基础的地区，要以提高为主，在提高中发展。
四、坚持公平竞争、扩大开放的原则
要全面落实《
国务院关于鼓励支持和引导个体私营等非公有制经济发展的若干意见》等文件精神，取消对乡镇企业的各种歧视性政策，为乡镇企业发展创造公平竞争的制度环境和市场环境。对中西部等发展慢的地区，要采取一定的倾斜政策支持乡镇企业发展。对东部乡镇企业发展快的地区，要加快推进乡镇企业对内对外开放，不断优化组合国内国际资源，积极实施“走出去”战略，大力开拓国际市场。
五、坚持节约资源、保护环境的原则
大力发展循环经济，鼓励乡镇企业发展资源节约型企业，淘汰耗能高、浪费大的技术、工艺和设备，限制高能耗企业生产。鼓励乡镇企业建设环境友好型企业，加大污染治理投入，严格限制污染环境的企业发展。要引导乡镇企业聚集发展，统一建设治污、排污等基础设施，降低污染治理成本。
六、坚持发挥比较优势、提升竞争能力的原则
乡镇企业要充分发挥自身土地资源、自然资源和劳动力资源较丰富和机制较灵活等方面的比较优势，大力发展劳动密集型和资源密集型产业，加快发展农产品加工业，注重提升企业自主创新能力，积极发展有市场、成本低、附加值高的产业和产品，不断提高乡镇企业的市场竞争能力。
第三节 主要目标
“十一五”期间（从2006年到2010年），乡镇企业发展力争实现总量发展目标、结构优化目标和技术进步目标。
一、总量发展目标
--增加值。预计以年均9.6%左右的速度增长，2010年达到79800亿元左右。
--工业增加值。预计以年均10%左右的速度增长，2010年达到57500亿元左右。
--出口产品交货值。预计以年均11%左右的速度增长，2010年达到34800亿元左右。
--从业人员。预计以年均增加250万人以上的速度增长，2010年达到1.5亿人以上。
--实缴税金。预计以年均9.5%左右的速度增长，2010年达到8200亿元左右。
二、结构优化目标
--区域结构优化目标。东部地区的乡镇企业要以提高为主，在提高中发展，适应资源和环境约束加重的新形势，走内涵和集约发展之路，不断提高产品的技术含量和附加值。中部地区的乡镇企业要以发展为主，在发展中提高，资源丰富的地区可适当走外延扩张之路，资源短缺的地区则要走内涵和集约发展之路。西部地区的乡镇企业要加大发展力度，充分利用资源优势，大力引进国内外资金，重点发展地方优势产业和特色经济。
--产业结构优化目标。第一产业乡镇企业要在稳定中提高，在设施农业、精品农业、生态农业、创汇农业、观光农业等特色农业领域有明显提高。第二产业乡镇企业要以内涵提高为主，重点发展资源节约型、环境友好型和技术密集型产业，大力发展农产品加工企业。第三产业乡镇企业要以发展为主，在继续巩固为居民生活服务的生活型服务业良好发展态势的同时，重点发展商贸、物流、金融和信息服务等生产型服务业。
