四、建设实施进度
全国新农合信息系统建设可分三个阶段进行：第一阶段（2006年－2007年底）：在推动县级网络建设与应用的同时，完成国家级和省级信息平台建设，完成国家级和省级中心数据库的规划和初步设计，完成第一期应用系统（以各省、自治区、直辖市数据汇总统计为重点）的开发和实施。首先实现全国第一批试点县新农合系统与省级系统的并网运行。第二阶段（2007年底－2008年底）：进一步完善和强化国家级和省级中心数据库的设计，完成第二期应用系统（以规范化数据采集、管理为重点）的开发和实施，以省为单位统一各县新农合管理软件系统，实现各县的规范化数据在省级中心数据库的集中存储。第三阶段（2008年底－2010年底）：完成全部系统设计和第三期应用系统（以数据综合管理、数据分析和数据挖掘为重点）的开发与实施，并随着新农合制度的不断推进，逐步实现全国新农合规范化数据的集中存储和分析。
五、保障措施
（一）加强领导。各级卫生行政部门在加快推进新农合工作中，要切实加强对新农合信息系统建设的领导，建立健全新农合信息化的管理协调机制，加强技术指导。各级卫生行政部门要按照《规范》和《通知》要求，制定切实可行的监督评估方案并组织实施。卫生部将组织有关专家检查、指导各地新农合信息系统建设。
（二）做好规划。各省级卫生行政部门应按照本指导意见提出的原则，在2007年2月底前，制定出本省（区、市）新农合信息系统建设方案。要充分考虑系统的整体性、科学性和可持续发展性，采取充分论证、试点运行、分步实施、全面推广的方法，紧密结合本地区实际，务求实效。
（三）加大投入。完善分级负担的新农合信息系统建设资金保障机制，兼顾建设和日常维护。中央财政对中西部地区省级平台建设给予补助，各地要落实信息系统建设投入并保障信息系统运转，发挥信息系统的效益，提高管理水平。各地要依据国家财经法律法规，完善新农合信息系统建设资金管理制度，实施对新农合信息系统建设资金使用的全过程监督管理，加强追踪问效。
（四）加强培训。加强对新农合信息系统有关人员的培训，从整体上提高信息系统管理和操作人员队伍的素质，形成科学管理团队，提高各级管理部门的应用能力。在确保系统安全性和核心技术自主性的前提下，引进国外先进技术和资金，加快全国新农合信息系统的建设与发展。
