（三）统一标准，分步实施。原则上要按照《规范》要求，逐步以省为单位统一合作医疗管理软件。暂不具备条件的地区，必须按照《规范》的要求，统一软件标准和数据接口标准。各省级卫生行政部门要加强与财政等相关部门的沟通，根据本指导意见及《财政部、卫生部关于补助公共卫生专项资金的通知》（财社〔2006〕126号，以下简称《通知》）要求，按照各地新农合信息系统建设规划和实施方案及财力等，组织招标采购，有重点、分步骤地逐年实施完成整个信息系统建设。在信息系统招标采购过程中，要切实选择具有经济实力、技术能力、行业经验和良好服务的合作单位共同进行新农合信息系统的建设和维护。
（四）规范管理，确保安全。国家级和省级新农合信息系统平台和数据库要建立在同级卫生行政部门。如省级以下设立新农合信息平台，可以建立在同级卫生行政部门，也可委托设在经信息产业行政部门认定具有ＩＤＣ（Ｉｎｔｅｒｎｅｔ Ｄａｔａ Ｃｅｎｔｅｒ，即互联网数据中心）资格的ＩＴ（Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，即信息技术）企业，接受委托的企业负责新农合信息系统的运行和日常维护。无论经办机构（含社保部门和保险公司）采取何种模式介入，其与新农合有关的业务信息都必须纳入各省级新农合信息系统中心数据库并接受上级卫生行政部门的业务管理与指导。未经省级及以上卫生行政部门批准，任何部门和单位不得转移、公布和使用新农合相关信息，更不能用于商业目的。要建立新农合信息系统管理制度，确保信息系统长期、持续和稳定运行。要严格遵守我国知识产权相关法律，购买和使用正版软件。严格按照国家有关信息安全的规定和标准建设、管理新农合信息系统，使之具有安全保护和保密措施以及应对计算机犯罪和计算机病毒的防范能力，确保系统和数据安全。
三、信息系统结构
（一）信息系统框架结构。全国新农合信息系统建设要逐步建成以两级平台（国家级、省级）为主，多级业务网络（国家、省、市、县）并存的模式。提倡按照省级建立信息平台，县级建立业务操作网络，市级通过省级平台建立辖区虚拟信息管理网络的方式建立省以下新农合信息系统。建设初期业务网络至少要覆盖到乡镇经办机构和同级的定点医疗机构，并随着业务的发展和管理的需要进行适当扩展。市、县两级是否建立信息平台，由各省级卫生行政部门根据具体情况，本着合理、节约、高效的原则确定。
