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研究内容：研究长江流域不同类型湖泊、水库食物网及营养动力学特征，包括各营养层次关键物种生态转换效率及其主要影响因素。定量分析放养结构调整对养殖水体生物群落结构、生物量和水质的影响，优化天然饵料资源管理，合理设置渔业布局，评估鳜、河蟹、鲂、黄颡鱼、鲌、鲴等主要经济水生动物类群的养殖生态容量。研究湖泊鱼类人工放养对野生群体的影响，开发湖泊人工放养的种质管理技术。开发湖泊不同生态类群优质渔业增养殖模式和技术工艺。研究水库有机渔业承载力和生态系统调控技术，开发有机渔业模式。
研究目标及主要技术经济指标：建立湖泊鳜、蟹、黄颡鱼等名特水产放养容量评估技术；提出湖泊水库大水面名特水产的不同生态类群（如鳜、蟹、黄颡鱼等）的放养技术，恢复湖泊优质水产种类资源结构，建立湖泊多种群渔业资源管理模型，建立湖泊增养殖鳜、河蟹、黄颡鱼等优质水产种类的规模化生产技术模式。建立30万亩的示范区，优质渔业种类增加2－3种，优质鱼类产量增加30%以上，显著提高湖泊渔业经济效益和生态效益。湖泊水质达到水源地水质标准。建立水库有机渔业承载力和鱼类适宜养殖容量的指标体系，制定水库有机渔业技术规程，试验区水库水产品质量达到有机水产品标准；建立水库有机渔业示范基地，水产品达到有机水产品质量标准，渔业经济效益提高15％；水质长期维持在II类水水平。
课题经费：国拨经费200万元，配套经费250万元。
课题3、高效环保渔用饲料配制技术开发与产业化示范
研究内容：研究完善草鱼、鲫鱼、河蟹、大黄鱼、鲈鱼、石斑鱼和军曹鱼的营养需求参数，确定主要饲料原料利用率参数；开展营养免疫学与无公害微生态添加剂的开发与应用技术、植物蛋白质原料中抗营养因子降解及鱼粉替代技术、饲料蛋白源取代对养殖品质风味的影响及调控技术、高效环保型人工配合饲料的配制技术和加工工艺等研究，进行水产饲料GMP生产示范，开展养殖投喂技术示范。
研究目标及主要技术经济指标：建立和完善草鱼、鲫鱼、河蟹、大黄鱼、鲈鱼、石斑鱼和军曹鱼大量营养素和主要微量营养素的需求参数库数据、主要饲料原料的生物利用率数据库；开发6种鱼类和河蟹的高效、低耗、无公害饲料，饲料系数低于1.5，氮、磷排放降低15-20%；完成具有知识产权的超低鱼粉用量（＜ 10%）的对虾、鲤鱼、罗非鱼的实用系列饲料配方；构建水产饲料生产《良好操作规范》（GMP）技术管理体系，并进行包括饲料生产和养殖投喂技术示范。申报发明专利4-5项。饲料年产量达到100万吨，建立饲料应用技术示范区7个，面积达到10万亩。
课题经费：国拨经费290万元，配套经费400万元。
课题4：渔药安全使用技术和新型渔药制剂开发
研究内容：研究新霉素、恩诺沙星、阿维菌素等15种主要渔药在鳗鲡、南美白对虾、河蟹等水产动物体内的药物代谢动力学及其残留消除规律。研究孔雀石绿等禁用渔药、溴氰菊酯等高毒药物的替代药物，制定其休药期、残留限量等技术参数，建立替代制剂安全使用技术规范。研究以恩诺沙星、二氧化氯和阿维菌素等渔药为模式药物的新剂型。研究孔雀石绿禁用渔药等的快速检测技术。制定合理的用药方法、残留限量、休药期与渔药安全使用技术规范，开展渔药安全使用示范。
研究目标及主要技术经济指标：提出新霉素、链霉素、卡拉霉素、恩诺沙星、沙拉沙星、双氟沙星、乳酸诺氟沙星、甲砜霉素、氟苯尼考、氟甲喹、痢菌净、盐酸小蘖碱、阿维菌素、甲苯咪唑、敌百虫等15种主要渔药在罗非鱼、鳗鲡、草鱼、银鲫、鲈鱼、河蟹、南美白对虾等水产动物体内的药物代谢动力学参数，制定15项以上渔药的残留限量、休药期与使用技术；研究出孔雀石绿等3种以上禁用渔药或有较大毒副作用渔药的替代药物；研究出2～3种渔药新剂型，疗效提高，毒副作用降低；建立3种以上渔药的快速检测方法，准确度达到80％以上，符合快速检测的要求；制定15种以上渔药的合理使用技术与规范；建立渔药安全使用示范区，示范面积达1万亩，辐射面积3万亩，养殖产品符合无公害水产品的质量要求，效益比对照区域提高10%～20%；申报专利3项，制定标准3项。
课题经费：国拨经费400万元，配套经费400万元。
课题5：商品化渔用疫苗研制和规模化应用示范
研究内容：针对我国主要养殖鱼类重大传染性疾病，包括鲢鲫鳙细菌性败血症、草鱼出血病、鳜鱼虹彩病毒病和嗜水气单胞菌病、斑点叉尾鮰疱疹病毒病、爱德华氏菌病和柱状曲挠杆菌病，中华鳖疖疮病，以及鲆鲽类弧菌病等，以现代生物技术为依托，研制高效疫苗，研究疫苗批量生产技术和疫苗规模化应用技术，开展产业化示范应用。
研究目标及主要技术经济指标：筛选主要养殖鱼类的重要疫苗抗原10～15种，筛选浸泡和口服型疫苗佐剂2～3种；研制鲢、鲫、鳙、草鱼、鳜鱼、斑点叉尾鮰、中华鳖和鲆鲽类等水产养殖动物主要疾病的疫苗产品5～7种，疫苗注射免疫保护率达80%以上，疫苗浸泡免疫保护率50%以上；建立配套的疫苗产业化技术体系，疫苗年生产能力达8000万ml；疫苗应用的养殖示范区2～3万亩，病害发生率降低20%-30%；申报或获得发明专利5～6个，制定标准4～5项，申请新药证书2个，申报疫苗生产文号2个。
课题经费：国拨经费440万元，配套经费440万元。
课题6：淡水工厂化养殖关键设备集成与高效养殖技术开发
研究内容：研究淡水工厂化高密度健康养殖模式，实现水循环利用和养殖污染“零排放”。研制微细悬浮颗粒物去除、生化反应器高效及小型化、难降解有机物深度氧化、低压增氧等高效水质净化设备和增氧设备，开发溶解氧、pH值、氧化还原电位等多参数自动水质监测与控制系统，优化和集成水处理工艺，大幅度降低水处理系统运行成本，使水处理循环利用技术达到广泛实用化水平，开发相应的健康养殖技术。
研究目标及主要技术经济指标：优化和集成2种以上的高效工厂化循环水养殖系统，水处理单元体积与养殖水体积之比低于0.25∶1，养殖水日循环利用率95％以上，能耗在现有基础上降低20％，产出1公斤鱼耗电2.0-2.8度，养殖废水排放达到渔业水质国家标准。开发澳洲宝石鲈、尖吻鲈、鳗鱼等名特优水产养殖品种的高密度循环水养殖模式，单产达到50kg/m3以上，养殖成活率95％以上，饲料系数低于1.5，产品达到绿色食品安全要求。建立淡水工厂化高密度健康养殖示范区2个，示范面积1万m2以上。微细悬浮颗粒物去除、生化反应器高效及小型化、难降解有机物深度氧化、低压增氧等设备的制造成本在现有基础上降低30％、净化效率在现有基础上提高20％。实现温度、pH、溶解氧、电导、氧化还原电位、氨氮等水质指标的实时在线监测，温度、pH、溶解氧、氧化还原电位的智能控制。制定工厂化养殖相关技术标准或规程2项以上，申请专利2项以上。
课题经费：国拨经费170万元，配套经费200万元。
课题7：水产名优品种优质高效养殖技术研究与示范
研究内容：针对河蟹、青虾、翘嘴红鲌、黄颡鱼等名优种类，研究长江下游优势产区池塘和湖泊网围生态高效养殖技术。研究池塘水质调控技术，利用底栖动物、水生植物等开发生物修复技术，建立池塘养殖生物操纵技术模式。研究轮牧式网围养殖技术模式，开发天然饲料资源合理利用技术，开发网围养殖环境修复技术。研究养殖水产品质量全程控制技术，开发河蟹、青虾等名优水产品均衡上市技术。
研究目标及主要技术经济指标：河蟹网围养殖平均规格达175克，其中200克占50%，单产40公斤/亩；池塘养蟹平均规格达150克以上，其中200克占30%。示范面积达20万亩，其中河蟹池塘养殖10万亩以上，湖泊网围养蟹2万亩以上，池塘养殖青虾示范面积达6万亩，翘嘴红鲌1万亩，黄颡鱼1万亩；示范区平均亩产提高10%-15%，经济效益提高10%，主要病害发病率下降10%-20%；池塘养殖排水达“淡水池塘废水排放标准”，水产品质量达无公害水产品质量标准；湖泊网围养殖区生物多样性指数提高10%。申请专利2个以上，制定相关技术操作规程与标准3?4个。
课题经费：国拨经费160万元，配套经费180万元。
课题8：名优鱼类苗种规模化繁育技术研究
研究内容：重点研究哲罗鱼、鲟鱼、大鲵、尖塘鳢、细鳞鱼、青蟹、篮子鱼、江鲽等名优养殖鱼类的生殖生理和繁殖生态需求，开展亲鱼培育、生殖调控、人工繁殖、苗种培育等关键技术研究，建立成熟的技术体系和规模化人工繁育的生产工艺；研究鲟鱼幼鱼早期性别鉴定、性别调控和规模化全雌养殖的关键技术。
研究目标及主要技术经济指标：苗种人工繁殖的催产率、受精率和孵化率平均达到80%以上。哲罗鱼培育亲体数量500组以上，年繁育苗种数量达50万尾以上；建立细鳞鱼亲鱼群体2000尾以上，年繁殖鱼苗30万尾以上；江鲽亲体数量200组以上，年繁育苗种数量100万尾以上；尖塘鳢年产2-3厘米鱼苗600万尾以上；大鲵年育苗量10万尾；培育篮子鱼亲本3000尾以上，年产鱼苗150万尾以上；青蟹大规格苗种（3cm以上）年产能力100万只以上；建立鲟幼鱼早期性别鉴定的免疫化学方法，鉴别准确率90%以上，养殖群体的雌性比例高于90%。建立苗种标准化生产体系，苗种规模化繁育基地9个；申报发明专利3-4项，申报新品种保护权2-3项。
课题经费：国拨经费180万元，配套经费190万元。
课题9：三峡生态渔业开发技术研究
研究内容：结合“三峡库区渔业发展规划”，研究三峡水库主要鱼类产卵场分布、资源变化趋势以及水库运行对鱼类资源的影响，开发主要土著鱼类资源增殖与保护技术；科学评估水库浮游生物生产力和悬浮物营养特征，研究水库滤食性和有机碎屑食性鱼类放养模型，开展库区水华生物控制技术研究，开发非投饵网箱高效生态养殖技术。
研究目标及主要经济技术指标：探明三峡水库四大家鱼等主要鱼类产卵场分布、资源变化趋势以及水库运行对鱼类资源的影响规律，建立主要土著鱼类资源增殖和保护技术；开发库区水华生物控制技术和非投饵网箱高效生态养殖技术；提高三峡水库渔业产量20%，渔业效益提高30%；申请专利2项，制定技术标准2项以上。
课题经费：国拨经费180万元，配套经费200万元。
课题10：淡水渔业标准化升级与技术体系建立
研究内容：开展重要产品质量安全、水质和有毒有害物质相关标准关键指标基础研究，为制定合理标准提供依据；通过水产养殖共性与关键技术的研究和产业化示范，研究建立不同生产模式、不同生产对象、不同生产环节、环境修复的单项技术标准和系统集成标准，为水产养殖增长方式转变构建有效的标准化技术体系。
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