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（一）粮食加工业
“十五”期间，我国粮食加工业取得了长足发展。2005年规模以上粮食加工企业8700个，实现工业产值3200亿元；粮食加工技术和装备水平不断提高，初步形成了优势明显的产业布局。“十一五”时期要继续改进粮食加工业企业规模小、粗加工能力过剩、深加工产品少、技术装备相对落后的问题。
1、发展方向和目标
重点抓好稻谷、小麦、玉米、大豆和薯类的精深加工与综合利用，兼顾杂粮的开发。小麦、稻谷加工继续以生产高质量、方便化主食食品为主，重点发展专用面粉、营养强化面粉、专用米、营养强化米、方便米面制品、预配粉等，推进传统主食品生产工业化；玉米加工除继续发展高质量的主食食品、休闲食品、方便食品等外，进一步发展应用前景广、市场需求潜力大的淀粉糖、有机酸、聚乳酸、变性淀粉、多元醇等精深加工产品；大豆加工重点发展大豆分离蛋白、大豆功能性蛋白、大豆组织蛋白和其他高附加值产品；薯类加工重点发展淀粉、全粉、变性淀粉、薯条（片）和方便湿粉等产品；杂粮加工重点发展荞麦、燕麦、豌豆、红豆等为原料的方便食品和功能食品。加大粮食综合开发利用力度，提高糠麸、胚芽、稻壳、豆渣、薯渣等副产物的综合利用水平。
“十一五”期末，初步建立起现代化粮食加工业体系。到2010年，粮食通过加工增值30%左右，深加工比例由目前的8%提高到15%左右；日处理稻谷100吨以上的碾米企业加工量占总加工量的比例由现在的33%增加到45%，日处理小麦200吨以上的面粉企业加工量占总加工量的比例由42%增加到50%以上。
2、区域布局
发挥粮食主产区的资源优势，以现有骨干企业为依托，通过技术进步和结构调整，达到合理经济规模。同时，发挥主销区的市场优势，重点培育联动作用强、辐射区域广的大型加工企业。
在北方、黄淮海等小麦主产区，发展生产面包、面条、饼干等优质专用粉加工企业，形成优质小麦加工产业群。在大中城市和东部沿海等小麦主销区，结合产业结构调整，发展大型企业集团，建立适合城市特点的主食品加工基地，推进面制主食品工业化。通过重组、兼并等形式，在主产区和主销区，培育形成 20家以上日处理小麦超过1000吨的大型制粉企业。
在东北、华东、华南、华中、西南等稻谷主产区，主要发展稻米的深加工企业，构建稻谷加工产业群，推进米糠、稻壳、碎米等综合利用，建设年处理稻谷15万吨～30万吨的加工企业；在珠江三角洲、长江三角洲以及部分大城市等稻米主销区，建设一批年产2万吨的大米主食品生产基地。
在东北三省和黄淮海两大玉米主产区，大力发展高油玉米、糯玉米、高直链淀粉玉米等优质专用玉米加工基地，逐步形成玉米深加工的产业群；在西南山地玉米产区、西北灌溉玉米产区和青藏高原玉米产区，重点发展特色玉米食品加工业。
利用中西部地区和东北地区的特色农业资源，建立杂粮和薯类加工基地，重点发展西北地区的荞麦、燕麦、大麦、小米、绿豆、蚕豆等加工业及东北、西南地区的马铃薯、甘薯和木薯加工业。
（二）食用植物油加工业
我国是食用植物油生产和消费大国。2005年食用植物油生产总量达到1612万吨，花色品种日益丰富，技术水平与国外差距明显缩小。但是，我国食用植物油加工业存在产能过剩、油料综合利用水平低、区域布局不够合理等突出矛盾。其中，大豆油加工原料的国际依存度超过50%，加工能力的70%集中在东南沿海地区。
1、发展方向和目标
在控制加工总量基础上，整合现有食用油加工资源，调整结构和区域布局，稳步发展花生油、大豆油、菜籽油和棉籽油等食用油，加快发展山茶油、红花油、橄榄油、米糠油、胚芽油等特色食用油，扩大精炼油和专用油的比重，提高油料综合利用程度，开发利用油料蛋白、生物活性物质等产品，同时推进传统豆制品工业化和新兴豆制品加工业的发展。
“十一五”期末，初步形成布局合理、发展有序、特色明显的油脂加工业体系。到2010年，食用油脂产量达到2500万吨以上，食用油精加工产品所占比例提高到70%；日处理大宗油料300吨以上的油脂加工厂的比例由目前的20%提高到45%；农村一、二级油的消费比例逐步提高。
2、区域布局
油料主产区以现有骨干加工企业为依托，优化资源配置，达到合理的规模；主销区重点培植生产规模大、联动作用强的大型企业，提升产品质量和档次，提高精深加工和综合利用水平。
在东北和黄淮海等大豆主产区，重点发展非转基因大豆加工业和大豆蛋白、磷脂等新兴大豆制品加工业，鼓励通过兼并、重组形成若干个日加工量1000吨以上的大豆制油企业，逐步形成产业集群；在渤海湾、长江三角洲和珠江三角洲等沿海地区，建成大型食用油深加工基地。
在南方油菜籽主产区和黄淮海花生主产区，以现有骨干企业为依托，培育形成若干个日处理油料1000吨及以上的大型菜籽油和浓香花生油加工企业；在东北、西北等葵花籽主产区，重点发展日处理500吨的中型葵花籽油精深加工生产线。在新疆、山东、河北、山西等产棉区，重点发展棉籽油、棉籽蛋白和脂肪酸衍生物、甘油、棉酚等产品。
在东北、华东、华中等稻谷产区和玉米产区，大力发展米糠油和玉米胚芽油等谷物油；在西北、西南及中南地区，重点发展油茶籽、油橄榄、红花籽、沙棘、葡萄籽、核桃等特种油料加工。
（三）果蔬加工业
我国果蔬资源产量居世界首位，果蔬产业已成为我国仅次于粮食的第二大农业支柱产业。“十五”期间，我国果蔬加工业持续快速发展，形成了环渤海和西北黄土高原两大浓缩苹果汁加工基地、西北番茄酱加工基地，东南沿海脱水蔬菜、罐头和速冻果蔬加工基地。与发达国家相比，我国果蔬产业仍然比较落后，采后损失率达20%～30%以上，果品和蔬菜深加工率不足10%和1%。
1、发展方向和目标
果品加工重点发展浓缩果汁、天然果肉原汁、非还原果汁、复合汁、果汁饮料、果酒以及轻糖型和混合型罐头，蔬菜加工重点发展低温脱水蔬菜、速冻菜、蔬菜罐头、切割菜、复合果蔬汁；鼓励农产品批发市场及农产品流通企业建设果蔬预冷、分级、、包装、贮运现代物流体系，加快果蔬皮渣综合利用和果蔬流通技术研究，开发果蔬功能产品。
“十一五”期末，基本建立我国现代果蔬加工和物流配送体系，形成布局合理、区域特色明显的果蔬加工业产业集群。到2010年，果蔬采后商品化率提高到60%以上，采后损失率降低到10%～15%，果蔬的深加工转化率分别达到10%～15%和3%～5%，果蔬皮渣的综合利用水平大幅度提高，经济效益进一步改善。
2、区域布局
在原料主产区重点发展浓缩果蔬汁（浆）、脱水果蔬、速冻果蔬、罐藏果蔬等加工业及贮运保鲜；在大中城市等主销区，重点发展果蔬汁等终端产品。同时，大力培育大型果蔬流通加工企业。
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