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加强自然保护区基础设施建设，提高监测与研究水平，加强对自然保护区周边资源开发活动的监控引导，完善自然保护区建设与管理的法规体系，建立自然保护区的警告、升降级及定期考评制度，对部分保护价值明显下降和管理水平低下的保护区，应进行警告、降级乃至撤销，促进自然保护区管理水平的提高。
优先完成230个国家级自然保护区的基本建设，将其中88个自然保护区建成规范化国家级自然保护区。开展全国自然保护区调查，初步形成国家级自然保护区监测体系，重点加强自然保护区国家和省一级的管理能力，制定自然保护区资源状况的调查和信息公布相关标准和规章制度，全面提升自然保护区和各级有关主管部门的管理能力。
4、加强自然生态系统保护
以促进人与自然和谐为重点，强化自然生态保护。优先保护天然植被，坚持因地制宜，重视自然恢复。继续实施天然林保护、天然草原植被恢复、退耕还林、退牧还草、退田还湖、防沙治沙、水土保持和防治石漠化等生态治理工程。严格控制土地退化和草原沙化。经济社会发展要与水资源条件相适应，统筹生活、生产和生态用水。
加强森林生态系统保护。加大天然林和生态公益林的保护力度，推进环境友好的林业建设方式，禁止陡坡开荒，严厉打击各类盗伐、超量采伐活动。加强对单一树种人工林建设的生态监管，对大规模林纸一体化项目及其造林基地建设要进行严格的生态环境影响评价。
保护和恢复湿地生态功能。严格限制围湖、围海造地和占填河道等改变湿地生态功能的开发建设活动。开展湿地生态功能与生物多样性保护，加强湖泊湖滨带保护区、湿地自然保护区建设与管理。
促进草原生态恢复与保护。加大天然草原保护和草地资源管理力度，合理划定轮牧区和禁牧区，禁止草原开垦行为。严格控制采集草原固沙野生植物和中草药材。大力发展沼气、风能、太阳能和生物质能等新能源，避免过度樵采对草灌植被造成破坏。
保护海洋生态环境。合理开发海洋资源，实施海洋环境综合管理，促进海洋经济发展。综合治理重点海域环境，遏制渤海、长江口和珠江口等近岸海域生态恶化趋势。恢复近海海洋生态功能，保护红树林、滨海湿地和珊瑚礁等海洋、海岸带生态系统，加强海岛保护和海洋自然保护区管理。完善海洋功能区划，规范海域使用秩序，严格限制开采海砂。
（二）强化区域生态保护监督与管理
1、加强资源开发的生态环境监管
严格控制破坏地表植被的开发建设活动，防治水土流失，重点控制农牧交错区的土地退化和草原沙化，在自然环境恶劣和生态环境超载的地区，加快实施移民搬迁。对资源开发活动的生态破坏状况开展系统的调查与评估，制定全面的生态恢复规划和实施方案，针对矿山、取土采石场等资源开发区、地质灾害毁弃地和塌陷地、大型工程项目建设区的裸露工作面开展生态恢复。加强生态恢复工程实施进度和成效的检查与监督，及时公布检查评估状况。加强对尾矿、矸石、废石等矿业固体废物及其贮存设施的监督管理，防止环境事故发生。
规范水资源开发行为，协调好生活、生产、生态用水，流域水资源开发利用规划要全面评估工程项目对流域和区域生态环境的影响，引导经济社会发展与水资源条件相适应，维持健康的水生态系统。在干旱与半干旱地区建设水坝和调水工程，要充分考虑生态用水需要。严格控制地下水开采量，地下水已严重超采的地区，应严禁新建取用地下水的供水设施，并逐步减少地下水取水量。在西部和北方水资源短缺地区，要严格限制高耗水产业发展。
强化旅游开发活动的生态环境保护工作，加大旅游区环境污染和生态破坏情况的检查力度，做好旅游规划中有关环境影响评价的审查、指导和督促。重点加强对生态敏感区域旅游开发项目的环境监管，建立健全地方性的规章制度、标准和考核办法，规范旅游开发活动，开展生态旅游试点示范。广泛开展宣传、教育、培训等活动，提高公众的旅游生态环境保护意识。
2、提高生物多样性履约和管理能力
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