基础教育等主要由财政拨款的特殊类型的事业单位，其医疗保险缴费主要由财政拨款安排。财政对不同事业单位医疗保险缴费的具体补助比例，可随着事业单位的改革，由同级财政部门确定。
(三)职工基本医疗保险基金按照国家规定全部用于职工基本医疗。社会保险经办机构开展职工基本医疗保险业务工作所需经费，由同级财政部门在预算中安排。各级财政部门要加强社会保险经办机构的财务管理，厉行节约，杜绝浪费。
三、职工医疗保险支出的列支渠道
(一)单位缴纳的职工基本医疗保险费：行政机关列“经常性支出”的“社会保障费”支出；事业单位列“事业支出”的“社会保障费”(专职从事经营活动的职工缴费列“经营支出”)；企业在职职工列支“应付福利费”，企业离退休人员列支“劳动保险费”。
(二)企业职工补充医疗保险费：国家批准建立补充医疗保险的特定行业，其补充医疗保险费在职工工资总额4％以内部分，列支企业“应付福利费”，“应付福利费”不足列支部分，经同级财政部门核准后可以列入成本。
财政部门应根据企业效益情况认真审核，从严把关。不是所有的企业都要建立补充医疗保险，建立的也不是都要达到职工工资总额4％的水平。
(三)实行医疗保险制度改革后，取消政府预算收支科目中“公费医疗经费”款级科目，设立“行政事业单位医疗经费”款级科目。财政部门安排的公务员基本医疗保险缴费、公务员医疗补助的支出、原享受公费医疗待遇的离休人员、老红军、二等乙级以上革命伤残军人、大学生的医疗费、财政对原不享受公费医疗待遇单位离休人员、老红军、二等乙级革命伤残军人医疗费超支给予的补助等支出在“行政事业单位医疗经费”款列支。
财政对事业单位职工基本医疗保险缴费的补助在有关事业费中列支。
四、加强职工基本医疗保险基金管理
加强职工基本医疗保险基金管理是城镇职工基本医疗保险制度运行成败的关键之一。各级财政部门一定要高度重视，与劳动保障部门及社会保险经办机构一起切实做好基金管理各方面的工作。
(一)认真按照“以收定支，收支平衡”的原则，加强职工基本医疗保险统筹基金支出管理。既要保障职工的基本医疗，又要量入为出，合理有效地使用医疗统筹基金，做到统筹基金不出赤字，略有结余。各级财政部门和劳动保障部门要对职工基本医疗保险基金收支情况进行严密监控和预测分析，建立健全基金赤字的预警机制，发现问题要及时研究提出平衡基金收支的对策和措施，重要情况要及时报告同级人民政府。
