第十一条 为保证项目的日常管理，对于研究期限为2年以上（含2年）的项目，每年年底应提交年度工作报告（格式见附2），由学校科技主管部门于次年1月20日前统一报送教育部科技司。逾期不报者，将视具体情况相应减少该校下一年申报项目的限额。
第十二条 项目研究经费为国家拨款，要严格按照国家关于科学事业费的使用和管理的有关规定列支，使用范围仅限于与本项目有关的内容，不得超出项目申请书的开支范围，如：罚款、捐款、赞助、投资等。不得列入国家规定禁止列入的其他支出。
第十三条 项目负责人一般不得代理或更换。遇有特殊情况（如病休等）离开该项目研究一年以内的，项目负责人须安排合适人选代理，并报教育部备案；离岗超过一年的，须更换合适的项目负责人（组织、业务能力应与原负责人相当），并由所在学校在三个月内报教育部审批(附更换者简历、学术水平、研究能力及完成项目的计划等)。教育部可视情况同意或中止项目，必要时可停止或追回拨款。因故需延期的项目，需报教育部同意后方可继续执行。
第十四条 对研究计划执行不力或难以按原定计划完成的项目，所在单位可建议予以终止、撤销，经教育部同意后办理有关手续。
第十五条 教育部每年对资助的重大项目进行定期检查。资助额度在80万元以上的重大项目，第一年拨付40%资助经费作为项目启动经费。项目开展一年后进行中期评估，剩余项目经费将结合中期评估意见按年度分期拨付，资助额度可视项目的进展情况做出必要的调整。
第四章 结题与验收
第十六条 项目结题或验收程序：
1．项目结题后，项目负责人应在3个月内填写结题或验收报告（格式见附3）。
2．资助额度在10万元以下（含10万元）并不参加评优的项目，可直接填写结题报告报学校主管领导后代替验收。
3．资助额度在10万元以下（含10万元）拟参加评优以及资助额度在11万元以上的项目必须验收。要求在项目验收前，由学校科技主管部门以公函的形式向教育部科技司提交验收申请（项目基本信息、单位意见、建议验收时间地点、提议的验收专家名单等），经教育部同意后，由教育部或委托学校主持验收。重大项目由教育部主持验收。
