４、国家环境保护总局组织有关科研单位和酸雨控制区内的省、自治区、直辖市环境保护局编制区域酸雨综合防治规划，于１９９９年６月底前完成。
二、强化环境监督管理措施
１、国务院经济综合主管部门会同国务院有关部门分期分批公布限期淘汰污染严重的小火电机组名录，关停、限产煤层含硫份大于３％的矿井名录，以及其他严重污染大气环境的工艺和设备名录，并负责监督实施。
２、各级环境保护部门应当遵循“以新带老、总量减少”的原则，严格审批新建、改造排放二氧化硫的项目。所有新建、改造排放二氧化硫的项目，必须采取有效措施控制二氧化硫排放量，确保区域二氧化硫排放总量控制在允许排放指标内。
３、各省、自治区、直辖市环境保护局要加强对超标排放二氧化硫的工业污染源的管理，监督工业污染源２０００年达标排放计划的实施。
４、“两控区”内城市的环境保护部门会同有关部门提出城市燃烧设施燃用煤炭和燃料重油的含硫量限值指标，报当地人民政府批准，并监督实施。
５、强化对现有二氧化硫排放源的监督管理，在“两控区”内实行二氧化硫排放许可证制度。
６、各省、自治区、直辖市环境保护局定期对辖区内城市和地区执行《国务院关于酸雨控制区和二氧化硫污染控制区有关问题的批复》的情况进行检查，并向国家环境保护总局报告“两控区”污染控制工作进展情况。国家环境保护总局定期发布“两控区”污染控制进展情况通报。
三、推行酸雨和二氧化硫污染综合防治的技术、经济政策
１、大力推行低硫煤、洗精煤和其他清洁燃料的使用，提高燃气、电力等清洁能源在城市能源结构中的比例。到２０００年，“两控区”内城市民用炉灶禁止燃用原煤，改用其他清洁燃料。
２、二氧化硫排放重点行业在制订本行业产业政策时要提出有利于减少二氧化硫排放、推行清洁生产的措施。
３、各省、自治区、直辖市人民政府有关部门要按照国家环境保护总局、国家发展计划委员会、
财政部和国家经济贸易委员会联合颁发的《关于在酸雨控制区和二氧化硫污染控制区开展征收二氧化硫排污费扩大试点的通知》（环发〔１９９８〕６号）要求，认真做好二氧化硫排污费的征收、管理和使用工作。
４、各地可根据当地情况，创造条件，试行二氧化硫排污交易制度，并及时总结经验。国家将在地方试行的基础上制定二氧化硫排污交易管理办法。
