符合条件的地质事业单位，应设置总会计师，协助单位主要负责人全面领导单位的财务工作。
地质事业单位必须单独设置财务机构，配备专职财会人员，单位财会主管人员的任免应当经过上一级财务主管部门的同意，不得任意调动或撤换。财会人员的调入、调出、专业技术职称的评聘须由单位的人事部门商财务部门后办理。
第二章 单位预算管理
第七条 地质事业单位预算是单位根据地质事业发展计划和任务编制的年度财务收支计划。
第八条 国家对地质事业单位实行按年度核定收支、定额或者定项补助、超支不补、结余留用的预算管理办法。
定额或者定项补助标准，根据地质事业发展计划、地质事业单位特点、财务收支状况，承担国家地质任务情况，以及国家财政政策和财力可能确定。
对国家赋予管理职能和主要从事国家基础性、战略性地质工作的单位，实行定额补助；对主要从事水文地质环境地质监测等社会公益性地质工作和技术开发服务的单位以及其他事业单位，实行定项补助。定额补助可以为零。
少数非财政补助收入大于支出较多的事业单位，可以实行收入上缴办法。具体办法由财政部门会同有关主管部门制定。
第九条 地质事业单位预算由收入预算和支出预算组成。
收入预算包括：财政补助收入、上级补助收入、事业收入、经营收入、附属单位上缴收入和其他收入。支出预算包括：事业支出、经营支出、自筹基本建设支出、对附属单位补助支出和上缴上级支出。单位预算必须全面反映单位收入和支出的内容。
第十条 地质事业单位预算应当自求平衡、统筹兼顾、保证重点，不得编制赤字预算。
第十一条 地质事业单位应参考以前年度预算执行情况，根据预算年度的收入增减因素和措施，测算编制收入预算，根据事业发展需要与财力可能，测算编制支出预算。
第十二条 地质事业单位根据年度事业计划提出预算建议数，经主管部门审核汇总报财政部门核定预算控制数（一级预算单位直接报财政部门，下同）。事业单位根据财政部门下达的预算控制数编制预算，由主管部门汇总报财政部门审核批复后执行。
第十三条 地质事业单位预算在执行过程中，国家对财政补助收入和从财政专户核拨的预算外资金一般不予调整。但是，上级下达的事业计划有较大调整、或者根据国家有关政策增加或减少支出、或者由于自然灾害等非常原因，对预算执行影响较大时，地质事业单位可以报请主管部门或者财政部门调整预算，非财政补助收入部分需要调增或者调减的，由单位自行调整并报主管部门和财政部门备案。
收入预算调整后，相应调增或者调减支出预算。
