（六）各级业务主管部门在重点检查中查出所属单位的违反财经法纪问题，对主管部门可视同自查处理。
（七）委托地方查出中央企事业单位应缴的各种违法违纪款项，可按其实际缴入中央财政应予分成的违法违纪金额，给地方财政以２０％的分成。
对地方大检查办公室组织查出企业应缴中央财政的消费税违法违纪款项，可按其实际缴入中央财政的消费税金额及其罚款和滞纳金，给地方财政以１０％的分成。查补的消费税可计入当地国家税务局征收任务数之内。
地方所得分成收入，年终由中央财政返还，纳入地方财政预算管理，在弥补大检查经费不足以后，用于发展社会公益事业，不得挪作他用。如有违反，要严肃处理。
有关委托地方检查中央单位和分成问题的具体规定，由财政部另行下达。
（八）对大检查中清理补缴的欠税问题，一般不作违纪处理。但对未经批准或超过批准期仍拖欠国家税款的，除将其欠缴税款如数追缴财政外，还要从滞纳之日起按日加收２‰的滞纳金。
（九）大检查查出有严重违法违纪问题和屡查屡犯行为的直接责任人，除按规定给予经济处罚外，还要按照干部管理权限，建议有关部门给予必要的党、政纪处分。触犯刑律构成犯罪的，移交司法机关惩处。
对阻挠、破坏检查的单位和个人，可视情节轻重，进行通报批评，或经本级人民政府同意后，采取其他处罚措施。
要坚决保护坚持原则的检查人员、财会人员和举报人，决不允许对他们进行任何形式的打击报复，如有打击报复的，应查明情况，严肃处理。
六、大检查需要重点抓好的几项主要工作
（一）切实加强对大检查工作的组织领导。１９９５年的大检查工作，在国务院和地方各级政府的直接领导和统一部署下进行。各地区、各部门务必把这项工作作为加强宏观调控和完善市场经济，促进财税、价格改革顺利实施以及加强廉政建设的一项重要措施，列入议事日程，摆到突出位置，切实抓紧抓好。各地区、各部门都要严格按照国务院《通知》的精神，建立健全大检查领导小组，指定一名领导同志负责大检查工作。在大检查期间，除国务院派出由部级干部带队的大检查工作组，分赴各地指导和推动大检查工作外，各地区也要以政府名义派出大检查工作组深入基层进行督促和检查；要继续邀请人大代表、政协委员和民主党派成员参加大检查工作，充分发挥他们的监督指导和参政议政作用。各级财政、国税、地税、物价、审计、监察等部门都要积极投入大检查工作。
地方各级大检查办公室是各级政府实施税收财务物价大检查工作的办事机构，具体负责组织实施大检查的各项工作，并依法检查处理各种违反财经法纪问题。中央各部门也要设立大检查办公室或指定专门人员负责大检查工作。
