提高科技创新能力是民营科技企业健康发展的重要保障。要指导大型民营科技企业建立健全技术开发机构，增加科技投入，吸纳科技人才和高等学校毕业生到企业工作，提高自身的研究开发和成果转化能力。促进各类民营科技企业与科研机构按照利益共享、风险共担的原则建立双边或多边技术协作，人才、技术资源互补；有条件的可以向国家有关部门申请设立企业博士后科研工作站。对于民营科技企业与科研机构联合兴建中试基地、工业性试验基地、工程技术中心、开放实验室等，当地有关部门应当给予支持。
鼓励有实力民营科技企业通过高新技术作价入股、租赁、兼并、收购等方式，积极参与中小企业的改革实践，用高新技术增量盘活资产存量，提高科技成果转化的规模化水平。对国有性质的民营科技企业兼并国有工业企业的，可比照执行《
国务院关于在若干城市试行国有企业兼并破产和职工再就业有关问题的补充通知》（国发〔１９９７〕１０号）中的有关政策。对资产规模较大、经营不善、濒临倒闭的国有企业，可在合理确定国有资产保值增值基数的基础上，委托民营科技企业经营。
三、理顺民营科技企业产权关系，完善企业制度
要根据国家有关规定解决民营科技企业中存在的产权关系不清问题。对因历史原因造成的民营科技企业与国有企事业单位的产权纠纷，要本着有利于鼓励成果转化、支持科技人员创业、保护国有资产权益的原则，妥善加以解决。要在企业决策、管理、分配等方面，充分保障个人产权持有者行使合法权益。
支持有条件的大型民营科技企业在明晰产权的基础上，按照《
公司法》进行公司制改造，逐步建立现代企业制度；允许中小型民营科技企业积极探索和完善股份合作制等新的企业组织形式，逐步向现代企业制度过渡。国有小型科研机构经有关部门批准，可通过股份制或股份合作制等方式改组成为民营科技企业。允许以自愿平等、有偿互利原则租赁经营国有小型科研机构；本单位科技人员集体提出租赁申请的，同等条件下应享有优先权。
引导民营科技企业重视和加强内部管理，逐步完善法人治理结构，建立科学高效的企业决策、管理、运营体制和经营者激励与约束机制，积极培养和聘用专业管理人才，向规范化、现代化的管理过渡，抵制急功近利、短期行为等不利于企业健康成长的经营思想，使企业发展建立在准确的市场预测、持续的技术创新和科学的经营管理之上。
四、加强对民营科技企业发展的指导和服务
