２．财政部门在批复事业单位预算时，应按照国家对事业单位实行核定收支、定额或者定项补助、超支不补、结余留用的预算管理办法，统一核定事业单位各项收入和支出预算。
对收入预算，应明确核定财政补助收入、事业收入（含从财政专户核拨的预算外资金收入）、经营收入等各项收入指标。
对支出预算，要统筹兼顾、确保重点，在核定事业支出、经营支出、自筹基本建设支出等分类支出数额情况下，还应核定工资、补助工资、社会保障费（包括离退休费用）、设备购置费、修缮费、业务费等重点项目的支出数额。自筹基本建设支出具体内容按基建财务规定列报。
对非财政补助收入大于支出较多，实行收入上缴办法的事业单位，应核定其上缴上级支出数额。
３．财政部门在核定事业单位预算时，财政补助定额或定项标准应根据事业特点、事业发展计划、事业单位收支状况以及国家财政政策和财力可能确定。既可以对事业单位确定一个总的补助数额，也可以针对事业单位某些支出项目（如工资、设备购置和修缮支出等）核定补助数额。
要改革事业经费分配“基数加增长”的传统做法，逐步实行“零基
预算法”，按照“社会共同需要”的原则，规范财政资金供给范围，对共同的支出项目制定统一的补助定额，在此基础上，对特殊支出项目要根据事业单位的特点，确定不同的补助标准和支持力度，优化财政资金支出结构。
预算外资金收入，应按照预算内、外资金结合使用的要求，与财政补助收入一并核定，统一下达。其数额应结合事业单位财务收支状况、事业单位纳入财政专户的预算外资金及按规定实行结余上缴专户的预算外资金数额确定。
财政补助收入和预算外资金收入应首先用于工资等人员支出以及必不可少的业务和设备购置开支。必须指定支出用途的，财政部门在核批事业单位收支预算时，应予以明确。
三、预算执行
事业单位预算经财政部门和主管部门核批以后，即成为预算执行的依据。事业单位应加强预算执行的管理工作。
１．事业单位要加强收入管理工作。取得的各项收入要及时入帐，不得坐支。按规定应上缴财政预算的要及时足额上缴；应上缴财政专户的预算外资金也要及时足额缴入财政专户，不能直接作为事业收入使用。主管部门和财政部门对事业单位应缴未缴财政预算和财政专户的资金要督促催缴。
