三是明确了监督抽查工作的抽检分离原则。为保证样品的真实性、检验数据的准确性和检验结论的公正性，参考国外发达国家在食品安全监测活动中普遍采用的方法，《办法》规定，“监督抽查按照抽样机构和检测机构分离的原则实施。抽样工作由当地农业行政主管部门或其执法机构负责，检测工作由农产品质量安全检测机构负责”。
四是明确了采用快速检测方法开展监督抽查的有关要求。《办法》规定，“采用快速检测方法检测的，应当遵守相关操作规范”，“采用快速检测方法进行监督抽查检测，被抽查人对检测结果有异议的，可以自收到检测结果时起四小时内书面申请复检”，“复检不得采用快速检测方法”。
五是明确了监测工作纪律。针对基层执法的工作实践，《办法》用专章规定了农产品质量安全监测工作的工作纪律，要求不得收取费用，同时明确了监测工作人员、检测机构弄虚作假、以权谋私的责任等。
二、全面加强农产品质量安全监测工作
各级农业（畜牧兽医、渔业）行政主管部门及检测机构要严格按照《办法》规定，科学规范开展监测工作。
一要加强风险监测。科学制定农产品质量安全风险监测计划和详细的工作方案，根据农产品质量安全风险隐患分布及变化情况，适当确定监测品种、监测区域、监测参数和监测频率。要采取符合统计学要求的抽样方法，确保样品代表性，客观反映农产品质量安全水平状况和存在的风险隐患。要加强风险监测结果会商分析和结果通报，为农产品质量安全监管工作提供有力支撑。
二要强化监督抽查。遵守抽检分离的原则，严格抽样、检测、确认、复检等程序，确保监督抽查程序的严谨、严肃和公正性。要加强检打联动，对监督抽检不合格的农产品，及时依法组织查处，或依法移交工商行政管理等有关部门查处，严厉打击违法行为。
三要建立监测信息平台。按照《全国农产品质量安全检验检测体系建设规划（2011-2015年）》（以下简称《二期规划》）关于完善省级综合质检中心风险监测与信息预警功能建设的要求，运用现代化信息技术手段，积极建立本行政区域内的农产品质量安全监测数据库，并与国家农产品质量安全监测数据库实现有效对接，构建全国统一的农产品质量安全监测信息平台。加强农产品质量安全监测信息采集、整理、综合分析和共享，提高监测结果运用水平。
四要加强监测工作保障。将农产品质量安全监测工作经费列入本部门财政预算，加大经费投入力度，保证监测工作正常开展。加大农产品质检机构扶持力度，认真执行《二期规划》，保质保量完成项目建设任务。创造条件吸引和储备高素质的检验检测技术人才，并加大培训交流力度，努力打造高水平的检测技术队伍。
