各级交通运输主管部门、港航管理机构要加强国内水路运输市场准入管理。完善水路运输行政许可流程，全面落实行政许可“首问负责、一次性告知、限时办结、效能投诉、责任追究”制度，逐步推行网上行政许可，进一步提高行政许可的办事效率，及时公开许可结果，提高透明度。原则上，办理《船舶营业运输证》不超过三个工作日，上报行政许可申请文件不超过十个工作日，不能办理的要及时回复申请人。要加强对已批准筹建企业和新增船舶运力的后续管理，不得为未取得运力许可或登记的船舶办理船舶营运手续，杜绝非法转让运力批准文件的行为。
要进一步强化服务意识，帮助企业应对油价上涨带来的影响。认真组织落实国家对水路客运的燃油补贴政策，加强对岛际和农村客运燃油补助工作的监督检查，认真开展岛际和农村客运成品油价格补助用油量的核定和申报，会同财政部门做好岛际和农村客运成品油价格补助资金、农村老旧渡船更新专项奖励资金的发放工作。要及时向当地人民政府反映水路运输行业发展动态和问题，积极争取出台有利于水路运输发展的税费等优惠政策和措施。要密切关注水路运输行业营业税改增值税改革，已经开始试点的地区，要积极配合有关部门加强调研，及时反映改革过程中出现的问题。
要规范收费和执法行为。各省级交通主管部门、港航管理机构要会同有关部门开展一次对水路运输企业和船舶的收费、罚款、摊派等情况的专项检查，坚决纠正执法执收违规行为和不合理的收费和摊派行为。
四、加强国内水路运输市场监管，促进水运行业稳定发展
各级交通运输主管部门、港航管理机构要加强对水路运输企业和船舶经营行为的日常监管，逐步健全国内水路运输企业和船舶诚信管理制度和经营资质预警及动态监管机制。要加大水路运输市场监管力度，对达不到经营资质条件的水路运输企业，应责令其整改，对整改后仍不能满足安全生产条件的，可依法取消其运输许可。要会同有关部门严厉打击市场垄断和不当竞争行为，维护良好的市场经营环境。
要加大水路运输企业安全隐患排查治理力度，重点加强对大型客船、客滚船、旅游客船、高速客船和危险品运输企业的管理。逐步健全对封闭水域内（除公园外）旅游客运市场的管理，建立和完善载客12 人以下小型客船运输市场的管理和日常监管。
五、开展国内水路运输行政管理工作专项检查，净化市场环境
各省级交通运输管理部门、港航管理机构要在2012 年四季度在本省（区、市）范围内组织开展一次水路行政管理工作专项检查，我部将视情组织督查和交叉互查。检查重点是交通运输部门和港航管理机构行政管理工作的开展情况（包括建立健全市场监测、报告与处置制度、市场准入政策的执行和帮扶企业政策措施的落实等工作）和国内水路运输经营者守法经营情况，结合贯彻落实国务院和交通运输部“打非治违”专项行动要求，加大对资质不保持、无证无照或证照过期及超范围经营、专职管理人员不配备或不履职、安全生产和经营管理制度不健全、责任不明确、措施不到位、委托管理船舶安全管理责任不落实等行为的检查和整治力度。各省级交通运输主管部门应于2012 年12 月底前，将本次专项检查的情况书面报部水运局。
